У меня есть файл 500 Мб в широком формате (132 столбца в ширину), где шесть столбцов являются переменными, описывающими экземпляр в момент времени от 1 до 16 (96 столбцов), а 36 из них не изменяющийся. Я хотел бы изменить структуру данных, чтобы у меня есть listcolumn для каждого из этих экземпляров и отдельный столбец для неизменяющейся информации. Имена переменных для экземпляров времени уникально задаются именами, заканчивающимися на «1».Перейдите от широкого блока данных к кадру данных с listcolumns
library(tidyverse)
a<-data_frame(id=c("A","B","C"),
const82=c("1952","1960","1970"),
const6=as.Date(today()-c(1:3)),
var1=c(1:3),
z21=c(letters[1:3]),
o31=c(11:13),
m41=c(LETTERS[11:13]),
var2=c(4:6),
z22=c(letters[4:6]),
o32=c(20:22),
m42=c(LETTERS[7:9]))
Так что я пробовал:
gather(a, ... = dplyr::contains(ends_with("1"))) %>% nest(-id,-const81,-const6)
Но я считаю, contains
не векторную, так что я не могу цикл по всем переменным, оканчивающиеся на «1». Кроме того, так же, как Group_by можно использовать для ввода в гнездо, я считаю, что было бы здорово иметь функцию, которая «вложила собранные столбцы».
Прыжки с tidyverse до data.table, я могу
a_long<-melt(setDT(a), id=c("id","const82","const6"),
measure=patterns(c("^var\\d","^z2\\d","^o3\\d","^m4\\d")),
value.name=vary<-c("var","z2","o3","m4"),
variable.name="num")%>%
nest(... = num:m4,.key=instance)
, который является более трудоемким, чем я надеялся, но заставляет меня остановить путь. Теперь, если я хочу добавить еще один listcolumn для постоянных переменных, я больше не могу использовать гнездо.
a_long%>% nest(-id,-instance)
Error in grouped_indices_impl(groups$data, groups$groups) :
cannot group column instance, of class 'list'
Так что-
- Как я могу сделать это легко?
- Я бы поверила, что эти listcolumns сохранили бы память из Object в том, что меньше информации дублируется в dataframe - но делает?
Желаемая структура данных - но шаги кажутся излишне сложными:
a_long %>% select(1:3) %>% nest(-id,.key = const) %>% left_join(a_long) %>% select(-const82,-const6)
вы можете поделиться ожидаемым выходом на основе ваших входных данных? – mtoto