0
Я пытаюсь использовать обычный кригинг для пространственного прогнозирования данных, где животное будет происходить на основе переменных-предикторов с использованием пакета gstat или automap в R. У меня много (более 100) дубликатов координатные точки, которые я не могу выбросить, поскольку эти станции были отобраны несколько раз в течение многих лет. Каждый раз, когда я запускаю код ниже для обычного кригинга, я получаю ошибку LDL, которая возникает из-за дублирования точек. Кто-нибудь знает, как решить эту проблему, не выкидывая данные? Я пробовал код из пакета automap, который должен исправлять дубликаты, но я не могу заставить это работать. Спасибо вам за помощь!Повторяющиеся данные при использовании пакета gstat или automap в R
coordinates(fish) <- ~ LONGITUDE+LATITUDE
x.range <- range([email protected][,1])
y.range <- range([email protected][,2])
grd <- expand.grid(x=seq(from=x.range[1], to=x.range[2], by=3), y=seq(from=y.range[1], to=y.range[2], by=3))
coordinates(grd) <- ~ x+y
plot(grd, pch=16, cex=.5)
gridded(grd) <- TRUE
library(gstat)
zerodist(fish) ###146 duplicate points
v <- variogram(log(WATER_TEMP) ~1, fish, na.rm=TRUE)
plot(v)
vgm()
f <- vgm(1, "Sph", 300, 0.5)
print(f)
v.fit <- fit.variogram(v,f)
plot(v, model=v.fit) ####In fit.variogram(v, d) : Warning: singular model in variogram fit
krg <- krige(log(WATER_TEMP) ~ 1, fish, grd, v.fit)
## [using ordinary kriging]
##"chfactor.c", line 131: singular matrix in function LDLfactor()Error in predict.gstat(g, newdata = newdata, block = block, nsim = nsim,: LDLfactor
##automap code for correcting for duplicates
fish.dup = rbind(fish, fish[1,]) # Create duplicate
coordinates(fish.dup) = ~LONGITUDE + LATITUDE
kr = autoKrige(WATER_TEMP, fish.dup, grd)
###Error in inherits(formula, "SpatialPointsDataFrame"):object 'WATER_TEMP' not found
###somehow my predictor variables are no longer available when in a Spatial Points Data Frame??
Пожалуйста, отредактируйте Q, чтобы включить «библиотечный» вызов (или ссылку), который делает доступным «рыба». –
О, извините, я новичок в этом. Должен ли я предоставлять свои личные данные (например, рыбу)? Я не знал, можно ли посмотреть на код и посмотреть, где я ошибся. –
Возможно, если вы найдете знающего пользователя этого пакета. Я не настолько, мне нужно иметь объект данных для работы. Вы можете получить ошибку с одним из объектов данных, предоставленных в gstat? (Первая ошибка также не похожа на полное сообщение об ошибке R.) –