2016-06-28 7 views
4

Я надеюсь, что вы можете помочь с этой проблемой я сталкивался во время установки RCurl и свертывания пакетов для R.R пакеты: RCurl и локон пакеты установка на отказ Linux

Rd warning: /tmp/RtmpOBkvFC/R.INSTALLd07e6c06faf4/RCurl/man/url.exists.Rd:5: missing file link ‘file.exists’ 
** building package indices 
** testing if installed package can be loaded 
Error in dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...) : 
    unable to load shared object '/home/majaidi/R/x86_64-redhat-linux-gnu-library/3.1/RCurl/libs/RCurl.so': 
    /lib64/libgssapi_krb5.so.2: symbol krb5int_buf_len, version krb5support_0_MIT not defined in file libkrb5support.so.0 with link time reference 
Error: loading failed 
Execution halted 
ERROR: loading failed 
* removing ‘/home/majaidi/R/x86_64-redhat-linux-gnu-library/3.1/RCurl’ 

The downloaded source packages are in 
    ‘/tmp/RtmpX6poG4/downloaded_packages’ 
Warning message: 
In install.packages(pkgs = pkgs, lib = lib, repos = repos, ...) : 
    installation of package ‘RCurl’ had non-zero exit status` 

ответ

0

Это выглядит, что у вас есть разные версии от libcurl. Один Approch может быть следующий один (для консоли):

wget https://cran.r-project.org/src/contrib/curl_0.9.7.tar.gz 
R CMD INSTALL curl_0.9.7.tar.gz --no-test-load 
ldd /home/majaidi/R/x86_64-redhat-linux-gnu-library/3.1/curl/libs/curl.so 

Затем вы можете использовать ldd libcurl.so найти все зависимости и разделяемых библиотек на это. Возможно, вы обнаружили ошибки и/или вам нужно создать новый LD_LIBRARY_PATH.

Удачи!
J_F

+0

Спасибо за помощь. Проблема с конфликтующей версией библиотек Kerberos. Настройка LD_LIBRARY_PATH помогла получить пакеты для успешной загрузки (как curl, так и RCurl) –

+0

@AmineJaidi Упростите ответ, если это было полезно –