Никогда раньше не использовался R, но последние несколько месяцев работал через Spatstat для анализа распределения клеток в раковой ткани. Я извлекаю xy координаты положительно окрашенных клеток для двух разных популяций клеток, чтобы генерировать отмеченные ppp. Изучение данных визуально через графики плотности и кросс-функции K/G и т. Д. Идентифицирует некоторые случаи, когда распределение двух клеточных популяций отличается по интенсивности. кроме того, в некоторых случаях клетки кажутся исключительными друг от друга, в то время как другие случаи характеризуются «горячими точками», разделяемыми обеими популяциями. Тем не менее, я не могу разобраться, как лучше всего продемонстрировать это, помимо наличия бок о бок изображений в качестве иллюстраций. Есть ли способ интегрировать два графика плотности или создать графику общих областей интенсивности? Или еще одна функция в Spatstat, которую я пропустил?Spatstat - сравнение пространственных шаблонов
Извинения, если это глупый вопрос, но изо всех сил пытаться продвинуться вперед и быть очень благодарны за совет.
Привет, Matt
Возможно, было бы полезно посмотреть на относительные риски двух типов. Взгляните на 'help (relrisk.ppp)' в 'doublestat'. –