os.system жалуется на круглые скобки

Question

Я пытаюсь включить эту строку в скрипт python.

!#/bin/bash/env python 

import os 

os.system("paste <(awk '!/^($|[:space:]*#)/{print $0}' file1) <(awk '!/^($|[:space:]*#)/{print $0} file2) > out_file") 

Команда отлично работает при запуске непосредственно из bash. Тем не менее, внутри сценария, я получаю:

sh: -c: line0: syntax error near unexpected token `(' 

Проблема сохраняется при использовании просто:

os.system("paste <(cat file1) > output_file") 

Есть идеи?

Answer 1

убить двух зайцев одним awk сценария:

awk -v DELIM=' ' '!/^($|[[:space:]]*#)/{a[FNR]=a[FNR]DELIM$0}END{for(i=1;i<=FNR;i++)print substr(a[i],2)}' file1 file2 

Это исключает необходимость замены процессов и является для них sh соответствует.

Answer 2

Команда отлично работает при запуске непосредственно из bash. Тем не менее, внутри сценария, я получаю:

sh: -c: line0: syntax error near unexpected token `(' 

Это потому, что внутри скрипта, вы запускаете команду с sh, а не bash. И эта команда, и более простая, используют bash -специальные функции. Попробуйте запустить оболочку sh и введите те же строки, и вы получите ту же ошибку.

os.system вызов не документ, что оболочка использует, потому что:

посредством вызова функции Standard C system()

На большинстве Unix-подобных систем, это вызывает sh. Вы, вероятно, не должны полагаться на это ... но вы определенно не должны полагаться на него, звоня по телефону bash!

Если вы хотите запустить bash команды, используйте subprocess модуль и запустить bash явно:

subprocess.call(['bash', '-c', 'paste <(cat file1) > output_file']) 

Вы могли бы, я полагаю, попытаться получить квотирование право запускать bash как субоболочке внутри оболочки system использует ... но зачем беспокоиться?

Это одна из многих причин, по которой в документации неоднократно указывается, что вы должны использовать subprocess вместо os.system.