OpenFOAM OpenMPI ошибка: libmpi.so.0 не найдено

Question

Всякий раз, когда я пытаюсь скомпилировать решатель в OpenFOAM, я получаю ошибку:

/usr/bin/ld: warning: libmpi.so.0, needed by /opt/openfoam211/platforms/linux64GccDPOpt/lib/openmpi-system/libPstream.so, not found (try using -rpath or -rpath-link) 
/usr/bin/ld: warning: libopen-rte.so.0, needed by /opt/openfoam211/platforms/linux64GccDPOpt/lib/openmpi-system/libPstream.so, not found (try using -rpath or -rpath-link) 
/usr/bin/ld: warning: libopen-pal.so.0, needed by /opt/openfoam211/platforms/linux64GccDPOpt/lib/openmpi-system/libPstream.so, not found (try using -rpath or -rpath-link) 
/opt/openfoam211/platforms/linux64GccDPOpt/lib/openmpi-system/libPstream.so: undefined reference to `MPI_Waitall' 
/opt/openfoam211/platforms/linux64GccDPOpt/lib/openmpi-system/libPstream.so: undefined reference to `MPI_Abort' 
/opt/openfoam211/platforms/linux64GccDPOpt/lib/openmpi-system/libPstream.so: undefined reference to `ompi_mpi_double' 
/opt/openfoam211/platforms/linux64GccDPOpt/lib/openmpi-system/libPstream.so: undefined reference to `MPI_Get_count' 
/opt/openfoam211/platforms/linux64GccDPOpt/lib/openmpi-system/libPstream.so: undefined reference to `MPI_Init' 
/opt/openfoam211/platforms/linux64GccDPOpt/lib/openmpi-system/libPstream.so: undefined reference to `MPI_Probe' 
/opt/openfoam211/platforms/linux64GccDPOpt/lib/openmpi-system/libPstream.so: undefined reference to `MPI_Send' 
/opt/openfoam211/platforms/linux64GccDPOpt/lib/openmpi-system/libPstream.so: undefined reference to `MPI_Allreduce' 
/opt/openfoam211/platforms/linux64GccDPOpt/lib/openmpi-system/libPstream.so: undefined reference to `ompi_mpi_packed' 
/opt/openfoam211/platforms/linux64GccDPOpt/lib/openmpi-system/libPstream.so: undefined reference to `MPI_Buffer_detach' 
/opt/openfoam211/platforms/linux64GccDPOpt/lib/openmpi-system/libPstream.so: undefined reference to `MPI_Bsend' 
/opt/openfoam211/platforms/linux64GccDPOpt/lib/openmpi-system/libPstream.so: undefined reference to `ompi_mpi_byte' 
/opt/openfoam211/platforms/linux64GccDPOpt/lib/openmpi-system/libPstream.so: undefined reference to `MPI_Irecv' 
/opt/openfoam211/platforms/linux64GccDPOpt/lib/openmpi-system/libPstream.so: undefined reference to `MPI_Recv' 
/opt/openfoam211/platforms/linux64GccDPOpt/lib/openmpi-system/libPstream.so: undefined reference to `ompi_mpi_comm_world' 
/opt/openfoam211/platforms/linux64GccDPOpt/lib/openmpi-system/libPstream.so: undefined reference to `MPI_Get_processor_name' 
/opt/openfoam211/platforms/linux64GccDPOpt/lib/openmpi-system/libPstream.so: undefined reference to `MPI_Test' 
/opt/openfoam211/platforms/linux64GccDPOpt/lib/openmpi-system/libPstream.so: undefined reference to `MPI_Isend' 
/opt/openfoam211/platforms/linux64GccDPOpt/lib/openmpi-system/libPstream.so: undefined reference to `MPI_Finalize' 
/opt/openfoam211/platforms/linux64GccDPOpt/lib/openmpi-system/libPstream.so: undefined reference to `ompi_mpi_op_sum' 
/opt/openfoam211/platforms/linux64GccDPOpt/lib/openmpi-system/libPstream.so: undefined reference to `MPI_Buffer_attach' 
/opt/openfoam211/platforms/linux64GccDPOpt/lib/openmpi-system/libPstream.so: undefined reference to `MPI_Comm_size' 
/opt/openfoam211/platforms/linux64GccDPOpt/lib/openmpi-system/libPstream.so: undefined reference to `MPI_Comm_rank' 
collect2: error: ld returned 1 exit status 

Я думаю, что проблема с установкой OpenMPI. Как я могу проверить/исправить ошибку?

Answer 1

Во-первых, убедитесь, что у вас действительно установлен Open MPI.

Во-вторых, убедитесь, что OpenFOAM правильно настроен для использования Open MPI: см. Соответствующие параметры в etc/bashrc (или etc/cshrc). Также убедитесь, что вы установили какие-либо необходимые переменные среды для Open MPI (у меня нет опыта работы с Open MPI, я строю с Intel MPI, и есть некоторые переменные среды, которые можно установить путем вызова какого-либо скрипта вручную).

В-третий, проверьте командные строки ссылки, выданные wmake построить свой решатель, и построить libPstream (во время основного процесса сборки OpenFOAM). Если он не печатает ссылку, отредактируйте wmake/Makefile, чтобы распечатать ее. Некоторые из этих строк (я думаю, libPstream) должны содержать некоторые параметры ссылок и, скорее всего, пути, связанные с Open MPI.