Как я могу контролировать версию Perl, используемую при отправке заданий на сетку?

Question

Я работаю с SGE (Sun Grid Engine), чтобы отправить задания в сетку. Я также использую perlbrew для управления моими установленными версиями Perl. я написал несколько коротких sh сценариев, которые я использую, чтобы запустить скрипт на языке Perl, который требует определенной версии Perl (5.12.2), которые выглядят примерно так:

#!/bin/bash 
#$-S /bin/bash 

source /home/dave/.bash_profile 
/home/dave/perl5/perlbrew/bin/perlbrew switch perl-5.12.2 

/home/dave/scripts/proc_12.pl --in=/home/dave/in/in.store --dir=/home/dave/in/dir2 --params=/home/dave/in/params.p 

Теперь, когда я представляю одно задание все работает хорошо, но когда я представляю много, я начинаю получать perlbrew соответствующие сообщения об ошибках, как:

ln: creating symbolic link `current' to `perl-5.12.2': File exists 
ln: creating symbolic link `/home/dave/perl5/perlbrew/bin/cpan' to `/home/dave/perl5/perlbrew/perls/current/bin/cpan': File exists 
ln: creating symbolic link `/home/dave/perl5/perlbrew/bin/cpan2dist' to `/home/dave/perl5/perlbrew/perls/current/bin/cpan2dist': File exists 
ln: cannot remove `/home/dave/perl5/perlbrew/bin/cpanp': No such file or directory 
ln: cannot remove `/home/dave/perl5/perlbrew/bin/enc2xs': No such file or directory 
ln: cannot remove `/home/dave/perl5/perlbrew/bin/find2perl': No such file or directory 

Так что я предполагаю, что /home/dave/perl5/perlbrew/bin/perlbrew switch perl-5.12.2 линия вызывает проблемы.

Что я могу сделать?

Как я могу запустить свой скрипт с использованием perl-5.12.2 (по умолчанию 5.8.8)?

Answer 1

Я не рекомендую помещать perlbrew switch perl-5.12.2 в любой скрипт, который вы запускаете. Это действительно только для использования в командной строке.

Если вам нужен скрипт, чтобы использовать конкретную версию Perl затем либо дать ему полный perlbrew путь на притон:

#!/home/dave/perl5/perlbrew/perls/perl-5.12.2/bin/perl 

use 5.012; 
use warnings; 
... 

Затем убедитесь, что его исполняемый файл и запустить так:

chmod +x your_perl_program.pl 
./your_perl_program.pl 

Или же использовать полный путь к PERL двоичном в сценарии:

#!/bin/bash 

/home/dave/perl5/perlbrew/perls/perl-5.12.2/bin/perl your_perl_program.pl 

Кстати, у вас возникнут потенциальные проблемы с производством и безопасностью, если вы будете запускать что-либо неквалифицированное в ваших сценариях или программах perl.Для например:

#!/bin/sh 

# security risk 
perl some_script.pl 

# and not just perl 
tar cvf archive.tar *.txt 

# production risk 
/home/dave/perl5/perlbrew/bin/perl some_other_script.pl 

Первые два плохо, потому что это будет забрать первый perl & tar он находит на своем пути. Так что это зависит от настройки $PATH, и это может стать угрозой безопасности. Последнее также не очень хорошо, потому что оно зависит от того, что perl perlbrew в настоящее время переключается на момент его запуска :(

Таким образом, это может быть потенциальным производственным кошмаром безопасности &. Вместо этого выше должно быть написано так: :

#!/bin/sh 

# fully qualified now. Uses OS provided perl 
/usr/bin/perl some_script.pl 

# ditto 
/usr/bin/tar cvf archive.tar *.txt 

# this needs to run in perl 5.12.2 
/home/dave/perl5/perlbrew/perls/perl-5.12.2/bin/perl some_other_script.pl 

Надежда, что все имеет смысл

Answer 2

Я бы порекомендовал против использования perlbrew. Это не дает вам такой большой ценности, и это просто вызывает путаницу в отношении того, что вы используете. perlbrew действительно предполагает, что все работает в то же время соглашается с тем, какой perl они должны использовать. Я думаю, что это всего лишь рецепт головных болей, поскольку разные программы начинают переходить из-под вас, возможно, прежде чем вы получите шанс использовать Perl, на который, по вашему мнению, переключились.

Просто установите нужные перлы и позвоните по той, которую вы хотите.

$ perl5.12.2 /home/dave/scripts/proc_12.pl ... 

Например, чтобы установить Perl вы просто запустить из дерева исходных текстов (с какой префикс требуется):

$ ./Configure -des -Dprefix=/usr/local/perls/perl-5.12.2 
$ make install 

Я тогда сделать символические ссылки на все мои установленных Перлз с моим make_links сценария. Когда я хочу использовать Perl 5.12.2, я просто использую ~/bin/perl5.12.2. Мне никогда не нужно переключаться. Когда я хочу установить модуль Perl, я использую CPAN для этого:

cpan5.12.2 Some::Module 

я никогда не знаю о том, какую версии я использую, и нет никаких условий гонки в движении симлинок вокруг.