2016-03-06 7 views
3

Мне было интересно, поддерживает ли gephi импорт файла кластера, который имеет назначение сообщества каждого узла в графе отдельной строки (аналогично формату Pajek .clu)? Я ищу способ окраски узлов, принадлежащих одному сообществу. В igraph (для R) я могу импортировать этот файл и установить на нем атрибуты цвета вершин. Интересно, имела ли гефи аналогичную функцию?Импорт пользовательского раздела в Gephi

Я видел этот ответ here более 5 лет назад, говоря, что это невозможно, было интересно, изменилось ли это сейчас?

Спасибо!

ответ

0

Файл .clu содержит одну строку на узел с номером кластера, по крайней мере, пример, который я вижу here. Gephi не может импортировать его напрямую, но вы можете обмануть его, чтобы получить тот же результат. Вот шаги, которые я предлагаю:

  1. Импорт файла .net с Gephi
  2. Перейти к Лабораторные данные и сортировки узлов в соответствии с Id колонки, нажав на название столбца
  3. Создать новый столбец Кластер путем нажатия Добавить столбец в нижней части экрана. Тип строки по умолчанию будет делать
  4. Нажмите Экспорт таблицы выберите только поля Id и кластера, а также экспортировать файл где-то
  5. Открыть CSV файл, например, с Excel или LibreOffice
  6. Откройте файл .clu с помощью текстового редактора, даже Notepad будет делать
  7. Скопируйте все числа в файл и вставить их в столбце кластера вашего CSV. Сохраните CSV
  8. Импортируйте CSV обратно в Gephi, нажав Import Spreadsheet и нажмите ok через следующие шаги.

В конце вы должны увидеть, что ваши значения кластера имеют те же значения, что и в файле .clu!

Убедитесь, что тот же полевой разделитель используется во всех этапах 4. и 8. Я бы предложил использовать ;, поскольку Excel непосредственно его понимает.

Вы можете сообщить об этом, если у вас все еще есть проблемы

+0

Спасибо! Извиняюсь за задержку в моем ответе. Мне удалось успешно импортировать значения кластера. Есть ли способ раскрасить узлы на основе столбца кластера? Извините, если это тривиальный вопрос, это мои первые несколько попыток использования Gephi для визуализации. – muddy

+0

Да, это мой ответ [здесь] (http://stackoverflow.com/questions/35215145/gephi-0-9-0-partition-panel/35225455#35225455)! Я надеюсь, что номера кластеров будут распознаны как строки, которые затем станут их категориальными атрибутами. У вас есть Gephi 0.9.1? –

+0

Да, я использую 0.9.1. Я смог раскрасить узлы, выполнив шаги, указанные в ссылке, которую вы дали. Спасибо за помощь! :) – muddy

 Смежные вопросы

  • Нет связанных вопросов^_^