0
У меня возникли трудности с созданием нескольких тепловых карт с пакетом ComplexHeatmap. Когда я запускаю скрипт, который содержит код точно поднятый из документации (https://bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/ComplexHeatmap/inst/doc/s3.a_list_of_heatmaps.html) ...Ошибка при создании нескольких тепловых карт с пакетом ComplexHeatmap
library(ComplexHeatmap)
mat1 = matrix(rnorm(80, 2), 8, 10)
mat1 = rbind(mat1, matrix(rnorm(40, -2), 4, 10))
rownames(mat1) = paste0("R", 1:12)
colnames(mat1) = paste0("C", 1:10)
mat2 = matrix(rnorm(60, 2), 6, 10)
mat2 = rbind(mat2, matrix(rnorm(60, -2), 6, 10))
rownames(mat2) = paste0("R", 1:12)
colnames(mat2) = paste0("C", 1:10)
ht1 = Heatmap(mat1, name = "ht1")
ht2 = Heatmap(mat2, name = "ht2")
class(ht1)
class(ht2)
ht1 + ht2
... Я получаю сообщение об ошибке:
Error in ht1 + ht2 : non-numeric argument to binary operator
Execution halted
Я бегу R версии 3.3.2 (2016-10-31) - «Искренняя тыквенная патч» на Mac OS X 10.12.2 с ComplexHeatmap версии 1.12.0. Спасибо за любую помощь!
Когда я запустил 'source (" https://bioconductor.org/biocLite.R "); biocLite («ComplexHeatmap») 'пару минут назад была установлена версия 1.10.2 (R 3.3.2, Windows). И я не мог воспроизвести вашу проблему. Возможно, версия ComplexHeatmap версии 1.12.0 нестабильна. – cuttlefish44
Это пришло мне в голову. Есть ли способ установить предыдущую версию? Я консультировался с документацией, но не видел никакого очевидного способа сделать это ... – brt381
'remove.packages (" ComplexHeatmap ")'. И запустите 'source (" https://bioconductor.org/biocLite.R "); biocLite ("ComplexHeatmap") 'или загрузить zip.file и установить его с помощью. – cuttlefish44