Это кажется предпочтительным способом, чтобы получить нужный формат, благодаря @ user20650
\documentclass{article}
\usepackage{colortbl}
\usepackage[usenames,dvipsnames]{xcolor}
\begin{document}
<<results='asis'>>=
library('xtable')
options(xtable.comment = FALSE)
df <- cbind(c("SUNE", "WST"), c("Apr 01", NA),
c("EXL", "VG"), c("Mar 18", NA))
out_table <- xtable(df)
align(out_table) <- "lll|ll"
print(out_table, floating = FALSE, hline.after = NULL,
include.rownames=FALSE, include.colnames=FALSE)
# \begin{tabular}{lll|ll}
# & 1 & 2 & 3 & 4 \\
# 1 & SUNE & Apr 01 & EXL & Mar 18 \\
# 2 & WST & & VG & \\
# \end{tabular}
attr(out_table, "align") <-
c("l", "l","l","!{\\color[HTML]{BDBDBD}\\vrule width .25pt}","l","l")
print(out_table, floating = FALSE, hline.after = NULL,
include.rownames=FALSE, include.colnames=FALSE)
# \begin{tabular}{lll!{\color[HTML]{BDBDBD}\vrule width .25pt}ll}
# & 1 & 2 & 3 & 4 \\
# 1 & SUNE & Apr 01 & EXL & Mar 18 \\
# 2 & WST & & VG & \\
# \end{tabular}
@
\end{document}
Результаты с

И некоторые другие варианты дилетантский:
Все это составляет заменял из {lll|ll}
для {lll!{\color[HTML]{BDBDBD}\vrule width .25pt}ll}
И вам нужен пакет Xcolor использовать шестнадцатеричный цвет, #BDBDBD
и colortbl для цветной VRule
\documentclass{article}
\usepackage{colortbl}
\usepackage[usenames,dvipsnames]{xcolor}
\begin{document}
<<results='asis'>>=
library('xtable')
options(xtable.comment = FALSE)
df <- cbind(c("SUNE", "WST"), c("Apr 01", NA),
c("EXL", "VG"), c("Mar 18", NA))
out_table <- xtable(df)
align(out_table) <- "lll|ll"
print(out_table, floating = FALSE, hline.after = NULL)
# \begin{tabular}{lll|ll}
# & 1 & 2 & 3 & 4 \\
# 1 & SUNE & Apr 01 & EXL & Mar 18 \\
# 2 & WST & & VG & \\
# \end{tabular}
cat(gsub(paste0(attr(out_table, 'align'), collapse = ''),
'lll!{\\color[HTML]{BDBDBD}\\vrule width .25pt}ll',
print(out_table, floating = FALSE, hline.after = NULL,
print.results = FALSE), fixed = TRUE))
# \begin{tabular}{lll!{\color[HTML]{BDBDBD}\vrule width .25pt}ll}
# & 1 & 2 & 3 & 4 \\
# 1 & SUNE & Apr 01 & EXL & Mar 18 \\
# 2 & WST & & VG & \\
# \end{tabular}
@
\end{document}
дает мне этот

В качестве альтернативы, если что-то подобное работает, это было бы намного проще, чем указано пользователем @ user20650 (хотя сначала я попытался что-то похожее, и мне было очень сложно о выравниваниях, но я, вероятно, просто что-то не так)
\documentclass{article}
\usepackage{colortbl}
\usepackage[usenames,dvipsnames]{xcolor}
\begin{document}
<<results='asis'>>=
library('xtable')
options(xtable.comment = FALSE)
df <- cbind(c("SUNE", "WST"), c("Apr 01", NA),
c("EXL", "VG"), c("Mar 18", NA))
out_table <- xtable(df)
align(out_table) <- "lll|ll"
print(out_table, floating = FALSE, hline.after = NULL)
# \begin{tabular}{lll|ll}
# & 1 & 2 & 3 & 4 \\
# 1 & SUNE & Apr 01 & EXL & Mar 18 \\
# 2 & WST & & VG & \\
# \end{tabular}
attr(out_table, 'align') <-
'lll!{\\color[HTML]{BDBDBD}\\vrule width .25pt}ll'
print(out_table, floating = FALSE, hline.after = NULL)
# \begin{tabular}{lll!{\color[HTML]{BDBDBD}\vrule width .25pt}ll}
# & 1 & 2 & 3 & 4 \\
# 1 & SUNE & Apr 01 & EXL & Mar 18 \\
# 2 & WST & & VG & \\
# \end{tabular}
@
\end{document}
И вы все еще получаете те же самые результаты:

(+1). Я думаю, что это хороший способ: возможно, установка выравнивания через атрибуты упрощает бит 'attr (out_table,« align ») <- 'lll! {\\ color {red} \\ vrule width 2.25pt } ll'' – user20650
@ user20605 это первое, что я пробовал, я сделал что-то неправильно, видимо, и получил ошибки, и пошел по этому более сложному пути – rawr
ах да, я вижу ... похоже, что он сталкивается с ошибками при исключении row.names – user20650