У меня есть скрипт, который зависит от трех переменных. таких как:файлы, содержащие переменные shell-скрипт
#!/bin/bash
/home/sugi/Desktop/rtg-tools-3.5.1/rtg vcfeval -b $1 -c $2 -t /home/sugi/Desktop/hg19.sdf --sample $3 -f AVR -o /home/sugi/Desktop/eval_{$3}
exit
Я хочу выполнить этот скрипт в списке образцов. для этого у меня есть 3 файла, содержащие расположение образцов и имена образцов. для каждой записи файлов должна выполняться приведенная выше команда. каждый из файлов имеет одинаковое количество записей в строке.
Для этого я попытался это:
cat file1.txt file2.txt file3.txt | xargs -i myscript.sh {} {} {}
однако это не работает. и я попытался несколько потоков также на StackOverflow, такие как «xargs с несколькими аргументами. Цените любую помощь. Thx.
вы хотите, чтобы петли по линиям в 3-х файлов параллельно – melpomene
использования 'paste' -.? http://stackoverflow.com/questions/4011814/how-to-interleave-lines-from-two-text-files –
@sugsiv То, что у вас есть, завершает каждую запись файлов. Я не понимаю, о чем вы просите. – melpomene