Как я могу покрасить узлы дендрограммы в виде отдельных строк в R

Question

Я хотел бы покрасить узлы дендрограммы в нижней части дендрограммы, но в отдельных строках Эта последняя дендрограмма по приведенной ниже ссылке показывает узлы как цветной - однако, когда его большой набор данных, что одна линия становится очень смазанной Label and color leaf dendrogram in r Так можно ли иметь отдельные строки для каждой цветной группы?

Answer 1

Да. Вы хотите использовать функцию colored_bars из пакета dendextend. Пожалуйста, смотрите следующий пример (из dendextend vignette)

library(dendextend) 
dend15 <- c(1:5) %>% dist %>% hclust(method = "average") %>% as.dendrogram 
is_odd <- ifelse(labels(dend15) %% 2, 2,3) 
is_345 <- ifelse(labels(dend15) > 2, 3,4) 
is_12 <- ifelse(labels(dend15) <= 2, 3,4) 
k_3 <- cutree(dend15,k = 3, order_clusters_as_data = FALSE) 
# The FALSE above makes sure we get the clusters in the order of the 
# dendrogram, and not in that of the original data. It is like: 
# cutree(dend15, k = 3)[order.dendrogram(dend15)] 
the_bars <- cbind(is_odd, is_345, is_12, k_3) 
the_bars[the_bars==2] <- 8 

dend15 %>% plot 
colored_bars(colors = the_bars, dend = dend15)