ClickOnce просто не установлен таким образом. Обычно они не имеют COM-крючков (для CreateObject) и устанавливаются в изолированной части профиля пользователя (а не в профиль этой машины). И не забывайте, что вы также можете получить несколько копий/версий одного и того же приложения сразу через ClickOnce (из разных мест).
Одним из вариантов (в 3.5/VS2008) может быть использование новых файлов ассоциаций файлов ... связать ваше приложение с файлами «.foo», создать пустой файл «.foo» и запустить его. Это может сработать. Посмотрите на диалог Publish => Options в VS2008.
В противном случае - в основном, если вы хотите использовать этот тип использования, я подозреваю, что вам нужно будет использовать msi (то есть обычный установщик, а не ClickOnce), чтобы зарегистрировать ваше приложение в виде библиотеки COM (dll). Обратите внимание: .NET не создает хороший COM-сервер (exe) - поэтому он не сравнивается напрямую с Word. Если вы хотите использовать COM-сервер .NET, то ваши «обслуживаемые компоненты» - ваш лучший выбор - но они не имеют большого значения в пользовательском интерфейсе.
Для информации изолированная область находится где-то около "% userprofile% \ Local Settings \ Apps \ 2.0", но это просто для интереса, чтобы вы могли ее увидеть .. не пытайтесь запустить его оттуда.