Я пытаюсь установить netcdf4 пакет на Ubuntu 14.04 с помощью следующей командыНевозможно установить h5py на Ubuntu 14.04 с Icc компилятором
PIP3 установить netcdf4
Эта же установка успешно, но когда я пытаюсь выполнить скрипт, который был импорт netCDF4 я получаю следующее сообщение об ошибке -
Traceback (most recent call last):
File "display.py", line 5, in <module>
from netCDF4 import Dataset # http://code.google.com/p/netcdf4-python/
File "/usr/local/lib/python3.4/dist-packages/netCDF4/__init__.py", line 3, in <module> from ._netCDF4 import *
File "netCDF4/_netCDF4.pyx", line 942, in init netCDF4._netCDF4 (netCDF4/_netCDF4.c:76006)
File "/usr/local/lib/python3.4/dist-packages/netcdftime/__init__.py", line 1, in <module>
from .netcdftime import utime, JulianDayFromDate, DateFromJulianDay
File "/usr/local/lib/python3.4/dist-packages/netcdftime/netcdftime.py", line 14, in <module>
from ._datetime import datetime
ImportError: /usr/local/lib/python3.4/dist-packages/netcdftime/_datetime.cpython-34m.so: undefined symbol: __intel_sse2_strchr
Так выглядит это имеет зависимость от Cython и hdf5. Я установил cython и успешно установил его.
Когда я делаю PIP3 установить h5py я получаю следующие ошибки -
Любые предложения? Я использую компилятор Intel icc и не могу переключиться на gcc.
Traceback (most recent call last):
File "<string>", line 1, in <module>
File "/tmp/pip_build_root/h5py/setup.py", line 149, in <module>
cmdclass = CMDCLASS,
File "/usr/lib/python3.4/distutils/core.py", line 148, in setup
dist.run_commands()
File "/usr/lib/python3.4/distutils/dist.py", line 955, in run_commands
self.run_command(cmd)
File "/usr/lib/python3.4/distutils/dist.py", line 974, in run_command
cmd_obj.run()
File "/usr/lib/python3/dist-packages/setuptools/command/install.py", line 53, in run
return _install.run(self)
File "/usr/lib/python3.4/distutils/command/install.py", line 583, in run
self.run_command('build')
File "/usr/lib/python3.4/distutils/cmd.py", line 313, in run_command
self.distribution.run_command(command)
File "/usr/lib/python3.4/distutils/dist.py", line 974, in run_command
cmd_obj.run()
File "/usr/lib/python3.4/distutils/command/build.py", line 126, in run
self.run_command(cmd_name)
File "/usr/lib/python3.4/distutils/cmd.py", line 313, in run_command
self.distribution.run_command(command)
File "/usr/lib/python3.4/distutils/dist.py", line 974, in run_command
cmd_obj.run()
File "/tmp/pip_build_root/h5py/setup_build.py", line 147, in run
from Cython.Build import cythonize
File "/usr/local/lib/python3.4/dist-packages/Cython/Build/__init__.py", line 1, in <module>
from .Dependencies import cythonize
File "/usr/local/lib/python3.4/dist-packages/Cython/Build/Dependencies.py", line 50, in <module>
from ..Compiler.Main import Context, CompilationOptions, default_options
File "/usr/local/lib/python3.4/dist-packages/Cython/Compiler/Main.py", line 28, in <module>
from .Scanning import PyrexScanner, FileSourceDescriptor
ImportError/usr/local/lib/python3.4/distpackages/Cython/Compiler/Scanning.cpython-34m.so: undefined symbol: __intel_sse2_strchr
Вы должны используйте python, скомпилированный с icc. Вы используете gcc-скомпилированную версию. Перекомпилируйте python, переустановите модули/wpp. – BadZen
@BadZen - python скомпилирован с icc. Однако как я могу проверить, с чем скомпилирован python? – gansub