У меня есть 2 временных ряда, и я использую ccf
, чтобы найти взаимную корреляцию между ними. ccf(ts1, ts2)
перечислены перекрестные корреляции для всех временных задержек. Как я могу найти отставание, которое приводит к максимальной корреляции без ручного поиска данных?Поиск запаздывания, при котором кросс-корреляция максимальная ccf()
ответ
Проводка ответ http://r.789695.n4.nabble.com/ccf-function-td2288257.html
Find_Max_CCF<- function(a,b)
{
d <- ccf(a, b, plot = FALSE)
cor = d$acf[,,1]
lag = d$lag[,,1]
res = data.frame(cor,lag)
res_max = res[which.max(res$cor),]
return(res_max)
}
Почему два запятых используются в cor = c $ acf [,, 1] и лагом? – Anusha
Я думал, что я повторить описанную выше функцию, но это найти абсолютную максимальную корреляцию, которая возвращает первоначальную корреляцию (положительный или отрицательный). Я также увеличил (почти) количество лагов.
Find_Abs_Max_CCF<- function(a,b)
{
d <- ccf(a, b, plot = FALSE, lag.max = length(a)-5)
cor = d$acf[,,1]
abscor = abs(d$acf[,,1])
lag = d$lag[,,1]
res = data.frame(cor,lag)
absres = data.frame(abscor,lag)
absres_max = res[which.max(absres$abscor),]
return(absres_max)
}
я изменил оригинальное решение, а также для того, чтобы петли по функции и вывода значения, соответствующие символьным вектором индексов (х):
abs.max.ccf <- function(x,a,b) {
d <- ccf(a, b, plot=FALSE, lag.max=length(a)-5)
cor <- d$acf[,,1]
abscor <- abs(d$acf[,,1])
lag <- d$lag[,,1]
abs.cor.max <- abscor[which.max(abscor)]
abs.cor.max.lag <- lag[which.max(abscor)]
return(c(x, abs.cor.max, abs.cor.max.lag))
}
я удалил data.frame
часть внутри функции, поскольку она излишне медленна. Для того, чтобы петли по каждому столбцу в data.frame
и возвращать результаты к новому data.frame
, я использую этот метод:
max.ccf <- lapply(colnames(df), function(x) unlist(abs.max.ccf(x, df$y, df[x])))
max.ccf <- data.frame(do.call(rbind, max.ccf))
colnames(max.ccf) <- c('Index','Cor','Lag')
Поскольку 3 больше, чем 4, я также имел удар на модификации этой функции, на этот раз путем реализации идея от here:
ccfmax <- function(a, b, e=0)
{
d <- ccf(a, b, plot = FALSE, lag.max = length(a)/2)
cor = d$acf[,,1]
abscor = abs(d$acf[,,1])
lag = d$lag[,,1]
res = data.frame(cor, lag)
absres = data.frame(abscor, lag)
maxcor = max(absres$abscor)
absres_max = res[which(absres$abscor >= maxcor-maxcor*e &
absres$abscor <= maxcor+maxcor*e),]
return(absres_max)
}
по существу термин «ошибка» добавляется, так что если есть несколько значений, близких к максимуму, все они получают возвращаются, например:
ayy <- jitter(cos((1:360)/5), 100)
bee <- jitter(sin((1:360)/5), 100)
ccfmax(ayy, bee, 0.02)
cor lag
348 0.9778319 -8
349 0.9670333 -7
363 -0.9650827 7
364 -0.9763180 8
Если не указано значение для e
, оно принимается равным нулю, а функция ведет себя точно так же, как и один nvogen.
Хорошо нашел ответ здесь http://r.789695.n4.nabble.com/ccf-function-td2288257.html – tan
Почему вы не ставите это как ответ и не кредитуете плакаты из списка рассылки помощи R ? –
Да, я бы сделал это, но у меня недостаточно очков репутации, чтобы ответить на мой собственный вопрос. – tan