Я пытаюсь создать 3d-модель каркасного каркаса из шаблона мозга MNI с использованием MyRobustCrust на Matlab. Моя цель - определить координаты MNI на поверхности коры.Создание трехмерной каркасной модели коры из шаблона мозга MNI с использованием Matlab с использованием MyRobustCrust
Чтобы сделать это, я, следуя инструкции, приведенные на этом сайте: http://soundsfromthenorth.com/?p=3
К сожалению, администратор, кажется, не быть активными.
Следуя инструкциям сайта, я успешно извлек набор данных («MNI152_T1_2mm_brain_mask.nii») из FSL. Однако, когда я иду запускать MyRobustCrust, используя следующий ввод (по указанию сайта), я получаю пустой граф.
ввода кода вывода
>> [t,tnorm]=MyRobustCrust(p);
figure(1)
hold on
axis equal
h=trisurf(t,p(:,1),p(:,2),p(:,3),'facealpha',0.4,...
...'facecolor',[1 1 1],'edgecolor',[0.8 0.8 0.8]);
view(3);
axis vis3d
Код:
Added Shield: 0.0559 s
Delaunay Triangulation Time: 0.6515 s
Connectivity Time: 0.0796 s
Circumcenters Time: 0.0168 s
Warning: Brute continuation necessary
> In MyRobustCrust>Marking (line 380)
In MyRobustCrust (line 106)
Warning: 1000 th level was reached\n
> In MyRobustCrust>Marking (line 412)
In MyRobustCrust (line 106)
99.9941 % of Tetraedroms were checked
Walking Time: 0.2084 s
Manifold extraction Time: 0.3782 s
Total Time: 1.4809 s
view(3);
|
Error: Unbalanced or unexpected parenthesis or bracket.
Я, к сожалению, очень новый нейровизуализации и Matlab. Есть ли у кого-нибудь какие-либо предложения относительно того, что я могу делать неправильно здесь? Сигнал ошибки указывает на дисбаланс или неожиданную скобку в коде для MyRobustCrust или в данных?
И сайт, и панель инструментов довольно устарели; heck, файл еще не доступен для загрузки на Файловом Exchange. Я заглянул в [this] (http://www.mathworks.com/matlabcentral/fileexchange/8998-surface-fitting-using-gridfit), чтобы узнать, может ли он делать то, что вы хотите. Но если вы расскажете больше о том, что вы на самом деле хотите сделать с этим, то, возможно, мы можем предложить другие подходы. – Setsu
Я пытаюсь создать 3d-модель поверхности мозга, которая, когда я наложу свой курсор, могу определить координату MNI этого местоположения. Моя цель состоит в том, чтобы иметь возможность перевести маркировку, сделанную на временном изображении изображения коры в координаты MNI. –