Как исправить 'TypeError: hasattr(): имя атрибута должно быть строкой' error?

Question

У меня есть следующий код:

import pymc as pm 
from matplotlib import pyplot as plt 
from pymc.Matplot import plot as mcplot 
import numpy as np 
from matplotlib import rc 

res = [18.752, 12.450, 11.832] 

v = pm.Uniform('v', 0, 20) 

errors = pm.Uniform('errors', 0, 100, size = 3) 

taus = 1/(errors ** 2) 

mydist = pm.Normal('mydist', mu = v, tau = taus, value = res, observed = True) 

model=pm.Model([mydist, errors, taus, v, res]) 
mcmc=pm.MCMC(model) # This is line 19 where the TypeError originates 
mcmc.sample(20000,10000) 

mcplot(mcmc.trace('mydist')) 

По какой-то причине он не работает, я получаю «TypeError: hasattr(): Имя атрибута должно быть строка» ошибка со следующим следом:

Traceback (most recent call last): 

    File "<ipython-input-49-759ebaf4321c>", line 1, in <module> 
runfile('C:/Users/Paul/.spyder2-py3/temp.py', wdir='C:/Users/Paul/.spyder2-py3') 

    File "C:\Users\Paul\Miniconda3\lib\site-packages\spyderlib\widgets\externalshell\sitecustomize.py", line 685, in runfile 
execfile(filename, namespace) 

    File "C:\Users\Paul\Miniconda3\lib\site-packages\spyderlib\widgets\externalshell\sitecustomize.py", line 85, in execfile 
exec(compile(open(filename, 'rb').read(), filename, 'exec'), namespace) 

    File "C:/Users/Paul/.spyder2-py3/temp.py", line 19, in <module> 
mcmc=pm.MCMC(model) 

    File "C:\Users\Paul\Miniconda3\lib\site-packages\pymc\MCMC.py", line 82, in __init__ 
**kwds) 

    File "C:\Users\Paul\Miniconda3\lib\site-packages\pymc\Model.py", line 197, in __init__ 
Model.__init__(self, input, name, verbose) 

    File "C:\Users\Paul\Miniconda3\lib\site-packages\pymc\Model.py", line 99, in __init__ 
ObjectContainer.__init__(self, input) 

    File "C:\Users\Paul\Miniconda3\lib\site-packages\pymc\Container.py", line 606, in __init__ 
conservative_update(self, input_to_file) 

    File "C:\Users\Paul\Miniconda3\lib\site-packages\pymc\Container.py", line 549, in conservative_update 
if not hasattr(obj, k): 

TypeError: hasattr(): attribute name must be string 

Как заставить его работать и выводить «mydist»?

Редактировать: Я отправил неправильный след сначала случайно.

Редактировать 2: Это все должно быть потому,

Answer 1

Я должен признать, что я не знаком с pymc, но изменить его на следующее по крайней мере, сделал запуск приложения:

mydist = pm.Normal('mydist', mu = v, tau = taus, value = res, observed = False) 

mcmc=pm.MCMC([mydist, errors, taus, v, res]) 

Это, кажется, потому что вы были оборачивать все в Модель, которая является продолжением ObjectContainer, но так как вы прошли это список, MCMCfile_items в Container.py пытался присвоить индекс 4 в списке что-то с помощью replace, но синк e Model - ObjectContainer ему присвоен ключ 4 в его __dict__, вызывающий странный TypeError у вас есть. Удаление обертывания Model вызвало ошибку MCMC для правильного использования ListContainer.

Теперь, есть, вероятно, ошибка в Model.py на line 543, где наблюдаемые стохастик не хранятся в базе данных - это выражение for object in self.stochastics | self.deterministics:, но я подозреваю, что она должна включать в себя self.observable_stochastics тоже - так что мне нужно, чтобы изменить observable к False или последняя строка будет бросать KeyError.

Я не достаточно хорошо знаком с pymc, чтобы определить, является ли это на самом деле или ошибка или желаемое поведение, поэтому я оставляю это до вас, чтобы представить issue об этом.

Answer 2

Вам просто нужно определить res как Numpy массива:

res = np.array([18.752, 12.450, 11.832]) 

Тогда вы получите ошибку здесь mcmc.trace('mydist') потому что mydist наблюдается данных, и, следовательно, не пробы. Вероятно, вы захотите построить другие переменные ...