Вы не указали, какой веб-сервер вы публикуете, но большинство плагинов веб-серверов реализуют публикацию путем копирования содержимого вашего проекта в другой временный каталог, где содержимое может быть собрано в форму, ожидаемую веб-сервером (отличается от формы проекта в рабочем пространстве Eclipse).
Как вы узнали, удаление файлов из вашего веб-приложения не обновляет ваш проект. Синхронизация является односторонней. Ожидается, что приложения не будут обновлять себя. Это не очень хорошая практика. В процессе производства ваше приложение не может быть развернуто как папка. Он может быть развернут .war-файл.
Данные приложения должны быть записаны в папку вне приложения.
Какой путь вы давите? относительный ? –
Вы обновили навигатор eclipse после удаления? – ManuPK