Я работаю над этой программой, превращая алгоритм разделения и покорения в динамический алгоритм программирования. Алгоритм предназначен для секвенирования (например, ДНК) и определения стоимости для этого. Просто повторить динамический алгоритм программирования работает, а разделение и победить - нет, и я не могу понять, почему.Динамическое программирование для разделения и покорения
#include<iostream>
#include <vector>
using namespace std;
int penalty;
int m, n;
char x[] = { 'A', 'A', 'C' }; //, 'A', 'G', 'T', 'T', 'A', 'C', 'C' };
char y[] = { 'T', 'A' }; //,'A' //, 'G', 'G', 'T', 'C', 'A' };
//find minimum
int min(int one, int two, int three)
{
if (one <= two && one <= three)
return one;
if (two <= one && two <= three)
return two;
return three;
}
//divide and conquer way of find the cost of the optimal path
int optMethod(int i, int j)
{
if (i == m)
return 2 * (n - j);
else if (j == n)
return 2 * (m - i);
else {
if (x[i] == y[j])
penalty = 0;
else
penalty = 1;
return min(optMethod(i + 1,j + 1) + penalty, optMethod(i + 1,j) + 2, optMethod(i,j + 1) + 2);
}
}
//dynamic programming way of finding cost of optimal path
void dynamicOptimal(vector<vector<int>>& opt1) {
for (int i = m; i >= 0; i--) {
for (int j = n; j >= 0; j--) {
if (i == m)
opt1[m][j] = 2 * (n - j);
else if (j == n)
opt1[i][n] = 2 * (m - i);
else {
if (x[i] == y[j])
penalty = 0;
else
penalty = 1;
opt1[i][j] = min(opt1[i+1][j+1] + penalty, opt1[i+1][j] + 2, opt1[i][j+1] + 2);
}
}
}
}
int main() {
m = sizeof(x);
n = sizeof(y);
//divide and conquer
cout << optMethod(0, 0) << endl;
//dynamic
vector <vector<int> > optimal(m+1, vector<int>(n+1, 0));
dynamicOptimal(optimal);
cout<<optimal[0][0]<<endl;
cin.get();
return 0;
}
То, что я получаю прямо сейчас, это то, что дается дополнительное наказание, но я не могу понять, где. [Примечание] Я знаю, что я не использовал зЬй :: мин, и я знаю его там
просто крошечной деталью: есть ' станд :: min'. –
Я знаю, мне просто нравится видеть это передо мной, и его не сложно написать –
@JoeM. Продолжайте экстраполировать логику «это не сложно», и вы можете вообще не докучать библиотекам. Это в сторону вашего «не сложно написать функцию» *** есть ошибка! *** –