Установите RODBC Mac OS Sierra 10.12.3

Обновите установку 10.12.1 с обновлениями до 10.12.3. Я сделал варить установку unixodbc. Я тогда попробовал R CMD INSTALL RODBC_1.3-14.tar.gz с ошибкой: проверка на gcc .../usr/local/opt/llvm/bin/clang -fopenmp проверка того, работает ли компилятор C. . нет настроить: ошибка: в /private/var/folders/7f/3n9kqyy13glcwlrx7h8cb5dc0000gn/T/RtmpYQnA2y/R.INSTALL354a771740af/RODBC': configure: error: C compiler cannot create executables See config.log»для получения более подробной информации оШИБКА: настройка не может быть для пакета„RODBC“Установите RODBC Mac OS Sierra 10.12.3

затем я распаковал RODBC и попытался ./configure и получил следующее сообщение об ошибке в журнале:

«Configure: 2690:/USR/местные/Opt/LLVM/бен/лязг -fopenmp -v> лязг версия 3.9.1 (теги/RELEASE_391/финал) Цель: x86_64-apple-darwin16.4.0 Модель темы: posix УстановленныйDir:/usr/local/opt/llvm/bin configure: 2701: $? = 0 configure: 2690:/usr/local/opt/llvm/bin/clang -fopenmp -V> clang: error: аргумент в '-V' отсутствует (ожидается 1 значение) clang: error: no входные файлы configure: 2701: $? = 1 настроить: 2690:/USR/местные/Opt/LLVM/бен/лязг -fopenmp -qversion> лязг: ошибка: неизвестный аргумент: '-qversion' лязг: ошибка: не введены файлы Configure: 2701 : $? = 1 configure: 2721: проверка, работает ли компилятор C configure: 2743:/usr/local/opt/llvm/bin/clang -fopenmp -Wall -mtune = core2 -g -O2 -I/usr/local/opt/llvm/include -I. conftest.c> ld: библиотека не найдена для -lomp clang: ошибка: не удалось выполнить команду компоновщика с кодом выхода 1 (использовать -v для вызова вызова) configure: 2747: $? = 1 configure: 2785: result: no "

источник

2017-02-07 davidf18

Я получаю сообщение об ошибке с lomp не найден, но я думал, что clang 3.9.1 имеет библиотеки openmp. "/ usr/bin/ld" -demangle -lto_library/usr/local/Cellar/llvm/3.9.1/lib/libLTO.dylib -dynamic -arch x86_64 -macosx_version_min 10.12.0 -o a.out/var/folders/7f/3n9kqyy13glcwlrx7h8cb5dc0000gn/T/conftest-c7544c.o -lomp -lSystem /usr/local/Cellar/llvm/3.9.1/bin/../lib/clang/3.9.1/lib/darwin/libclang_rt.osx.a ld: библиотека не найдена для -lomp – davidf18

У меня была такая же проблема. Для меня проблема заключалась в том, что установщик R полагался на компилятор clang, поставляемый с OS X (Sierra, 10.12.4), который does not support openmp.

Я также не мог получить любой из обычных средств для указания другого компилятора configure работать (например, в качестве примеров here), потому что, как выясняется, настроить скрипт RODBC является жестко использовать компилятор и lib/include, указанные вашей установкой R, которые описаны here.

Я смог решить проблему проблему путем редактирования ~/.R/Makevars, чтобы указать на версию gcc я установил через MacPorts (sudo port install gcc6), как такового:

CC=/opt/local/bin/gcc-mp-6 -fopenmp 
CXX=/opt/local/bin/g++-mp-6 
LDFLAGS=-L/opt/local/lib -L/usr/local/opt/llvm/lib 
CPPFLAGS=-I/opt/local/include -I/usr/local/opt/llvm/include

Тогда нормальный процесс установки (R CMD INSTALL ./RODBC_1.3-15.tar.gz) работала как ожидалось.

источник

2017-04-25 15:51:03 ryguy

ответ

Смежные вопросы