Как создать gexp с позициями, такими как диаграмма узлов?

Question

Я создаю диаграмму ссылок на узел, используя ruby ​​и sigma.js.

то, что я хочу

но то, что я есть сейчас:

, потому что я не установлен узел позиции (х, у) в gexp.

фон:

теперь у меня есть структура дерева в базе данных,

это просто генерировать gexp без позиций.

но как создать позиции узлов, например, первое изображение в программе?

кажется Gephi может это сделать, но gephi не может работать как командная строка.

Answer 1

Gephi может работать как инструмент командной строки, на Java: https://gephi.org/toolkit/.
В наборе Gephi Toolkit используйте макет ForceAtlas и сохраните файл как gexf, и действительно позиции будут сохранены.