Объедините два одноканальных стека TIFF в один многоканальный стек

Question

У меня есть два набора Tiff с временными данными, соответствующими различным каналам, полученным в эксперименте по микроскопии. Я хотел бы объединить их в один стек с двумя каналами. Оба стека имеют 16-битный оттенок серого.

Когда я использую:

convert stack1.tiff stack2.tiff stack_merged.tiff 

я один, но каскадный файл с двумя стопками один за другим.

Ссылки на file 1 и file 2.

Answer 1

Я думаю, что нужно что-то вроде этого:

#!/bin/bash 

# Get index of last frame in TIFF image 
last=$(convert stack1.tif -print "%[fx:n-1]" null:) 

# Combine all frames 
for i in `seq 0 $last`; do 
    convert stack1.tif[$i] stack2.tif[$i] -combine miff:- 
done | convert miff:- -compress lzw result.tif