0
Я хочу скомпилировать пакет hsphase (пакет R доступен в CRAN).Ошибка компиляции пакета R
Я использовал эту команду в R install.packages("hsphase").
я получил следующие ошибки:
g++ -m64 -shared -L/usr/lib64/R/lib -Wl,-z,relro -specs=/usr/lib/rpm/redhat/redhat-hardened-ld -o hsphase.so FastDist.o MAF.o Ohd.o TypeConversion.o block.o block4Phase.o co.o diag.o hsp.o main.o memory.o oh.o swDetect.o [1] 0 -L/usr/lib64/R/lib -lRlapack -L/usr/lib64/R/lib -lRblas -lgfortran -lm -lquadmath -fopenmp -L/usr/lib64/R/lib -lR
g++: error: [1]: No such file or directory
g++: error: 0: No such file or directory
/usr/share/R/make/shlib.mk:6: recipe for target 'hsphase.so' failed
make: *** [hsphase.so] Error 1
ERROR: compilation failed for package ‘hsphase’
* removing ‘/home/mhf/R/x86_64-redhat-linux-gnu-library/3.3/hsphase’
The downloaded source packages are in
‘/tmp/RtmpYukJQa/downloaded_packages’
Warning message:
In install.packages("hsphase") :
installation of package ‘hsphase’ had non-zero exit status
Я использую Fedora 24.
Г ++ версии: GCC версии 6.1.1 20160621 (Red Hat 6.1.1-3) (GCC)
Пожалуйста, проверьте флаг ссылки: что это: [1] 0
g ++ есть. Ошибка связывания. – user1436187
У меня была аналогичная проблема с установкой другого R-пакета, и позже выяснилось, что некоторые из зависимостей для требуемого пакета отсутствуют, попробуйте 'install.packages (« hsphase », dependencies = TRUE)' –
Кажется, что вам не хватает системно- уровень зависимости; такие строки - '-specs =/usr/lib/rpm/redhat/redhat-hardened-ld' - хорошая подсказка. См. [Этот вопрос] (http://stackoverflow.com/questions/34624428/g-error-usr-lib-rpm-redhat-redhat-hardened-cc1-no-that-file-and-directory). – nrussell