pydot и Graphviz ошибка: Не удалось импортировать dot_parser, загрузка файлов точек будет невозможно

Question

Когда я бегу очень простой код с pydot

import pydot 
graph = pydot.Dot(graph_type='graph') 

for i in range(3): 

    edge = pydot.Edge("king", "lord%d" % i) 
    graph.add_edge(edge) 

vassal_num = 0 
for i in range(3): 
    for j in range(2): 
    edge = pydot.Edge("lord%d" % i, "vassal%d" % vassal_num) 
    graph.add_edge(edge) 
    vassal_num += 1 

graph.write_png('example1_graph.png') 

Он печатает мне сообщение об ошибке:

Couldn't import dot_parser, loading of dot files will not be possible. 

Я использую python 2.7.3

Answer 1

Ответ на pydot >= 1.1:

Несовместимость (вверх по течению) pydot было зафиксировано 6dff94b3f1, и, таким образом pydot >= 1.1 будет compatible with pyparsing >= 1.5.7.

---

Ответ применимы к pydot <= 1.0.28:

Для всех, кто попадается на это, это связано с изменениями в Pyparsing от 1.x до выпуска 2.x. Чтобы установить pydot с помощью пип, сначала установить более старую версию Pyparsing:

pip install pyparsing==1.5.7 
pip install pydot==1.0.28 

Если вы не установили pyparsing с помощью pip, но вместо этого используется setup.py, то есть смотреть на эту solution деинсталлировать пакет. Спасибо @qtips.

Answer 2

Решение не должно было устанавливать pydot откуда-то, но «python-pydot» из официальных репозиториев ubuntu.

Answer 3

pydot использовал частную переменную модуля (_noncomma) от pyparsing. Ниже дифференциал фиксирует его использовать для Pyparsing 2.0.1:

diff --git a/dot_parser.py b/dot_parser.py 
index dedd61a..138d152 100644 
--- a/dot_parser.py 
+++ b/dot_parser.py 
@@ -25,8 +25,9 @@ from pyparsing import __version__ as pyparsing_version 
from pyparsing import (nestedExpr, Literal, CaselessLiteral, Word, Upcase, OneOrMore, ZeroOrMore, 
    Forward, NotAny, delimitedList, oneOf, Group, Optional, Combine, alphas, nums, 
    restOfLine, cStyleComment, nums, alphanums, printables, empty, quotedString, 
- ParseException, ParseResults, CharsNotIn, _noncomma, dblQuotedString, QuotedString, ParserElement) 
+ ParseException, ParseResults, CharsNotIn, dblQuotedString, QuotedString, ParserElement) 

+_noncomma = "".join([ c for c in printables if c != "," ]) 

class P_AttrList: 

Answer 4

Я раздвоенное хранилище pydot [1], применяется патч Габи Давар и некоторые изменения для поддержки Python-3. Пакет доступен в PyPI [2].

Приветствия

• [1] https://pypi.python.org/pypi/pydot2/1.0.32
• [2] https://pypi.python.org/pypi/pydot2

Answer 5

Существует новый пакет в пип репо под названием pydot2, что работает правильно с pyparsing2. Я не мог понизить мои пакеты, потому что matplotlib зависит от нового пакета pyparsing.

Примечание: python2.7 из MacPorts

Answer 6

На OSX Mavericks следующий сделал трюк ... Я получил ту же ошибку, но в нижней части была также жалобы о том, что Graphviz исполняемый файл не присутствовал ... Я думаю, проблема в том, что я установил graphviz перед другими модулями?

brew uninstall graphviz 
brew install graphviz 

Answer 7

Есть теперь по крайней мере еще 2 версии, которые появляются для поддержки Pyparsing-2 и Python-3:

• PyDotPlus по Carlos Jenkins с хорошим Travis BuildBot и фантазии documentation. Однако вам нужно будет изменить его имя папки от site-packages\pydotplus до site-packages\pydot, чтобы он работал с существующими программами, которые импортируют pydot.
• pydot3k by bmcorser. К сожалению, не работает!
• prologic/pydot Джеймс Миллс ссылку с официальной pydot кодовой страницы Google, как ...

  a branch for Python 3 compatibility

• and here is a working link to David Villa's pydot2 which works fine: https://pypi.python.org/pypi/pydot2/1.0.32

Answer 8

$ sudo pip uninstall pydot

$ sudo pip install pydot2

Смотрите следующую ссылку: http://infidea.net/troubleshooting-couldnt-import-dot_parser-loading-of-dot-files-will-not-be-possible/

Answer 9

Это работало для меня (Mac OS X 10.9 с Python 2.7.10 на Anaconda):

conda uninstall pydot 

Затем

conda install pydot 

Pyparsing затем понижен (от 2.x до 1.5.7) после установки pydot в. Future Googlers: это позволило мне правильно установить и импортировать Theano.

Answer 10

У меня была проблема снова, и мое решение выше не срабатывало. Если это верно для вас, и вы также используете Anaconda на Mac с El Capitan, попробуйте следующее:

conda install --channel https://conda.anaconda.org/RMG graphviz` 
conda install --channel https://conda.anaconda.org/RMG pydot 

Answer 11

Вам нужно понизить Pyparsing версии 2.х до версии 1.5.7, чтобы получить pydot правильно работать ,

Для Win-64, используя в Конда, это работает для меня:

conda install -c https://conda.anaconda.org/Trentonoliphant pyparsing=1.5.7 

Затем я отключил/деинсталлировать версию 2.x и перезагружается Pyparsing в моем сценарии:

pyparsing = reload(pyparsing) 
pydot = reload(pydot) 

Чтобы проверить есть ли у вас правильная версия:

Answer 12

Когда другие решения не работают, это быстрый и грязный метод для решения проблемы:

Этот пример из python 2.7 на Ubuntu 16.04.

Редактировать файл python2.7/site-packages/keras/utils/visualize_util.py и прокомментировать сегмент кода ниже.

if not pydot.find_graphviz(): 
    raise ImportError('Failed to import pydot. You must install pydot' 
         ' and graphviz for `pydotprint` to work.') 

find_graphviz() является излишним в новых версиях pydot и выше вызов не работает.

Answer 13

То, что я сделал в конце после стольких попыток от того, что я видел здесь (псевдо последовательности для того, чтобы работать на NetworkX):

apt-get remove python-pydot 
pip install pydotplus 
apt-get install libcgraph6 
apt-get install python-pygraphviz 


# pip freeze | grep pydot 
pydotplus==2.0.2 
# pip freeze | grep pyparsing 
pyparsing==2.2.0 
# pip freeze | grep graphviz 
pygraphviz==1.2 
# python -c 'import pydotplus' 
# 

Answer 14

я встретил эту проблему и мой pydot == 1.0.28 в то время как pyparsing == 2.2.0. Я исправил проблему, загрузив новую версию pydot 1.2.3 (tar.gz) из Google, а затем установил ее в автономном режиме. Когда я обновил pydot в ubuntu 14.04, он сказал, что pydot 1.0.28 - самая новая версия. Поэтому я загружаю из версии google 1.2.3.