R corrplot изменение метки данных

Question

Я использую библиотеку R corrplot. Это выглядит потрясающе, однако для создания действительно хорошего графика я хочу изменить метки строк и столбцов корреляционной матрицы.

Одно решение сделать что-то вроде этого:

cbak <- colnames(my.data.frame) 
colnames(my.data.frame) <- c("a", "set", "of", "labels") 
corrplot(cor(my.data.frame)) 
colnames(my.data.frame) <- cbak 

Однако это выглядит странно и некрасиво.

Я думаю, что я должен работать с параметром labels функции text(), но я не могу понять, как это сделать.

corrplot(cor(my.data.frame), labels=c("a", "set", "of", "labels")) 

приводит

Error in text.default(pos.xlabel[, 1], pos.xlabel[, 2], newcolnames, srt = tl.srt, : 
    invalid 'pos' value 
In addition: Warning message: 
In text.default(pos.xlabel[, 1], pos.xlabel[, 2], newcolnames, srt = tl.srt, : 
    NAs introduced by coercion 

Как сделать это правильно?

Answer 1

В текущем corrplot версии 0.75, вы не можете использовать labels параметр, поскольку метки X и Y вычисляются в зависимости от corrplot()colnames() и rownames() входных corr матрицы.

Я использую подобный подход, как вы предложили:

M <- cor(mtcars) 
colnames(M) <- c("a", "set", "of", "x", "labels", 1:6) 
corrplot(M, method = "color") 

BTW, я связал это StackOverflow вопрос от нашего выпуска GitHub трекере: https://github.com/taiyun/corrplot/issues/20

UPDATE: В текущем corrplot версия 0.78, также выражения plotmath допускаются в именах переменных. Просто прикрепите свое имя одним из символов «:», «=» или «$».

Пример:

M <- cor(mtcars)[1:5,1:5] 
colnames(M) <- c("alpha", "beta", ":alpha+beta", ":a[0]", "=a[beta]") 
rownames(M) <- c("alpha", "beta", NA, "$a[0]", "$ a[beta]") 
corrplot(M)