Docker: как установить RCurl в контейнер Docker?

Question

Я пытаюсь установить RCurl в контейнер Docker, ремикс this Dockerfile, но сбой. Таким образом,

Как установить RCurl в контейнер Docker?

Dockerfile

$ cat Dockerfile 
FROM r-base 
RUN apt-get -y install r-base 
RUN pip install rpy2 
RUN apt-get -y install libcurl4-openssl-dev 
#setup R configs 
RUN echo "r <- getOption('repos'); r['CRAN'] <- 'http://cran.us.r-project.org'; options(repos = r);" > ~/.Rprofile 
RUN Rscript -e "install.packages('yhatr')" 
RUN Rscript -e "install.packages('ggplot2')" 
RUN Rscript -e "install.packages('plyr')" 
RUN Rscript -e "install.packages('reshape2')" 
RUN Rscript -e "install.packages('forecast')" 
RUN Rscript -e "install.packages('stringr')" 
RUN Rscript -e "install.packages('lubridate')" 
RUN Rscript -e "install.packages('randomForest')" 
RUN Rscript -e "install.packages('rpart')" 
RUN Rscript -e "install.packages('e1071')" 
RUN Rscript -e "install.packages('kknn')" 
RUN Rscript -e "install.packages('RCurl')" 
RUN Rscript -e "install.packages('rjson')" 

Docker недостаточность instalaltion

trying URL 'https://cran.rstudio.com/src/contrib/RCurl_1.95-4.8.tar.gz' 
Content type 'application/x-gzip' length 916934 bytes (895 KB) 
================================================== 
downloaded 895 KB 

* installing *source* package ‘bitops’ ... 
** package ‘bitops’ successfully unpacked and MD5 sums checked 
** libs 
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG  -fpic -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/r-base-3.3.2=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c bit-ops.c -o bit-ops.o 
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG  -fpic -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/r-base-3.3.2=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c cksum.c -o cksum.o 
gcc -std=gnu99 -shared -L/usr/lib/R/lib -Wl,-z,relro -o bitops.so bit-ops.o cksum.o -L/usr/lib/R/lib -lR 
installing to /usr/local/lib/R/site-library/bitops/libs 
** R 
** preparing package for lazy loading 
** help 
*** installing help indices 
** building package indices 
** testing if installed package can be loaded 
* DONE (bitops) 
* installing *source* package ‘RCurl’ ... 
** package ‘RCurl’ successfully unpacked and MD5 sums checked 
checking for curl-config... no 
Cannot find curl-config 
ERROR: configuration failed for package ‘RCurl’ 
* removing ‘/usr/local/lib/R/site-library/RCurl’ 

The downloaded source packages are in 
    ‘/tmp/RtmpJrfUvL/downloaded_packages’ 
Warning message: 
In install.packages("RCurl") : 
    installation of package ‘RCurl’ had non-zero exit status 
---> b8de6bc67379 
Removing intermediate container e8c17d0306ef 

Answer 1

Дирк предложил установить из бинарных файлов, которые упомянутых hadleyverse построить в качалку here:

Docker изображения обеспечивая RStudio + rmarkdown/pandoc/латекс + R пакет экосистемных от Hadley Уикхемом

поэтому мы получаем множество дополнений помимо основного RCurl.

Ниже вы создаете контейнер из изображения докеров, а затем запускаете его с помощью каталога с вашего хоста, оставляя вас в интерактивной оболочке bash. Там вы можете открыть сеанс R с $ R в командной строке, где работает команда install.packages('RCurl').

$ docker build -t 20170127_r . 

$ docker run -v ~/Desktop/20161213_project/:/project -it 20170127_r bash` 

Dockerfile

#R with RCurl 
#https://github.com/rocker-org/hadleyverse/blob/master/Dockerfile 
# 
FROM rocker/verse 
MAINTAINER "Carl Boettiger and Dirk Eddelbuettel" rocker-maintainers@eddelbuettel.com 

## Install some external dependencies. 
RUN apt-get update \ 
    && apt-get install -y --no-install-recommends \ 
    default-jdk \ 
    default-jre \ 
    icedtea-netx \ 
    libbz2-dev \ 
    libcairo2-dev \ 
    libgdal-dev \ 
    libicu-dev \ 
    liblzma-dev \ 
    libproj-dev \ 
    libgeos-dev \ 
    libgsl0-dev \ 
    librdf0-dev \ 
    librsvg2-dev \ 
    libv8-dev \ 
    libxcb1-dev \ 
    libxdmcp-dev \ 
    libxslt1-dev \ 
    libxt-dev \ 
    mdbtools \ 
    netcdf-bin \ 
    && . /etc/environment \ 
    && install2.r -e -r $MRAN rJava \ 
    && R CMD javareconf \ 
    && apt-get clean \ 
    && rm -rf /var/lib/apt/lists/ \ 
    && rm -rf /tmp/downloaded_packages/ /tmp/*.rds 
## tidyverse, devtools and related R packages already inherited from rocker/verse 

## httr authentication uses this port 
EXPOSE 1410 
ENV HTTR_LOCALHOST 0.0.0.0 

, где не ясно, какие пакеты достаточно для установки RCurl.