Друг прислал меня по этому замечательному учебнику на webscraping NYtimes with R. Мне бы очень хотелось попробовать это. Однако первым шагом является установка пакета из RJSONIO из источника.Как установить пакет R из исходного кода?
Я знаю R достаточно хорошо, но я понятия не имею, как установить пакет из источника.
Я бегу Mac OSX.
Если у вас есть файл локально, а затем использовать install.packages() и установить repos=NULL:
install.packages(path_to_file, repos = NULL, type="source")
Где path_to_file будет представлять полный путь и имя файла:
"C:\\RJSONIO_0.2-3.tar.gz"."/home/blah/RJSONIO_0.2-3.tar.gz".Это также работает, если 'file_name_and_path' является локальным исходным репозиторием пакета R. –
Обратите внимание, что опция 'INSTALL_opts' может использоваться для передачи параметров в' R CMD INSTALL'. Например, «--no-multiarch» –
Это, похоже, не работает с zip-архивами. – Cerin
Скачать исходный пакет, откройте Terminal.app, перейдите в каталог, где вы в настоящее время есть файл, а затем выполнить:
R CMD INSTALL RJSONIO_0.2-3.tar.gz
Обратите внимание, что это только успех, когда: а) пакет не нуждается в компиляции или b) имеются необходимые системные инструменты для компиляции. См: https://cran.r-project.org/bin/macosx/tools/
Я пробовал это и получал ошибку: Madjoro-MacBook-Pro: ~ Madjoro $ R CMD INSTALL RJSONIO_0.2-3.tar.gz Предупреждение: неверный пакет 'RJSONIO_0.2-3.tar.gz' Ошибка: ОШИБКА: пакетов не указан – 2009-09-24 22:51:23
Вы должны указать правильный путь к .ta r.gz и инструменты XCode (http://developer.apple.com/TOOLS/Xcode/). – rcs
Есть ли способ построить двоичный .zip из источника? – haridsv
Вы можете установить непосредственно из хранилища (обратите внимание на type="source"):
install.packages("RJSONIO", repos = "http://www.omegahat.org/R", type="source")
Я попытался это и получил ошибку: * Установка * источник * пакет «RJSONIO» ... ** ЛИЭС ** арка - i386 ш: сделать: команда не найдена ОШИБКА: компиляция не удалось для пакета «RJSONIO ' RMate остановился на линии 3 * Удаление '/Library/Frameworks/R.framework/Versions/2.9/Resources/library/RJSONIO' загруженные пакеты в \t'/частный/вар/папки/Ey/EyzhYjoKESmsmsZ6K87PeU + ++ TI/-Tmp-/Rtmpe3C96p/downloads_packages ' Обновление индекса HTML пакетов в' .Library ' Предупреждающее сообщение: В install.packages ("RJSONIO", repos = "http : //www.omegahat.org/R ",: установка пакета 'RJSONIO' имела ненулевой статус выхода – 2009-09-24 22:48:46
У вас установлены инструменты для разработчиков? Они входят в установочный dvd для Mac OS X. Поскольку у этого пакета есть код C, вам понадобится компилятор для его установки из источника. –
Я подозреваю, что у меня нет установленных инструментов разработчика. По крайней мере, я не помню их установки. Благодаря! – 2009-09-24 23:26:53
Кроме того, вы можете создать двоичный пакет с помощью --binary опции.
R CMD build --binary RJSONIO_0.2-3.tar.gz
'R CMD build --binary' устарел; используйте 'R CMD INSTALL --build' вместо – f3lix
Дополнительный (но тривиальный) совет для установки более старой версии пакетов из источника.
Во-первых, если вы вызываете «install.packages», он всегда устанавливает последний пакет из репо. Если вы хотите установить более старую версию пакетов, скажем, для совместимости, вы можете вызвать install.packages («url_to_source», repo = NULL, type = «source»). Например:
install.packages("http://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/RNetLogo/RNetLogo_0.9-6.tar.gz", repo=NULL, type="source")
без ручной загрузки пакетов на локальный диск и переход к командной строке или установки с локального диска, я нашел, что это очень удобно и упростить вызов (один шаг).
Plus: вы можете использовать этот трюк с dev_mode Devtools библиотеки, для того, чтобы управлять различными версиями пакетов:
Ссылка: doc devtools
From cran, вы можете установить непосредственно из адреса репозитория GitHub. Так что если вы хотите пакет в https://github.com/twitter/AnomalyDetection:
library(devtools)
install_github("twitter/AnomalyDetection")
делает трюк.
Я предпочитаю устанавливать пакет от R cran project.Я буду искать имя пакета, и если он будет доступен, я буду выполнять команду из моей оболочки R, чтобы установить ее непосредственно из проекта R-крана. Ваш пакет доступен в каталоге R. Так это то, что я буду делать
install.packages("RJSONIO")
Bonus - Загрузка пакета в текущей сессии R
library(RJSONIO)
Это не отвечает на вопрос, речь идет не о ваших предпочтениях, а о том, как установить из источника. – GolDDranks
Это очень тесно связано: http://stackoverflow.com/questions/11105131/can not-install-r-forge-package-using-install-packages – GSee