Декодирование в Python

Question

Я пытаюсь обнаружить текст, закодированный в ASCII, найденный в последовательности ДНК из файла.

Ниже мой код:

Первый открыть файл FASTA и установить является переменной.

with open("/home/<username>/python/progseq") as mydnaseq: 
    sequence = mydnaseq.read().replace('\n','') 

Это второй бит, чтобы перевести последовательность в двоичную и сделал это для буквы C и G/T равным 1:

binarysequence = sequence.replace('A','0') 

Затем я взял эту loooooong двоичную последовательность и хотел сделать это в 8bits:

for i in range(0,len(binarysequence),8): 
    binarysequence [i:i+8] 

Это то создал такой вывод:

'00110100' 
    '00110010' 
    '01000110' 
    '00011000' 
    '0' 

Хотя у меня был гораздо более длинный выход, я включил только последние четыре последовательности.

Хотел бы узнать, как его преобразовать в буквы.

Answer 1

С, например. a = '10010000', вы можете сделать

b = chr(int(a, 2)) 

для первого преобразования a в целое на основе двоичного числа, а затем интерпретировать это число как символ. Обратите внимание, что многие из этих 8-битных целых чисел не приведут к чтению символов!

Конкретным примером является

b = chr(int('01111000', 2)) 
print(b) 

которые приводят к 'x' печати.