Параллельное выполнение задания, которое принимает несколько входов в Linux

Question

У меня есть файл со списком путей. например:

/Работа/пользователь/1007/GVFS/кого-л-доля: сервер = xeonator, доля = с/Результаты/нормалей/8_mo/CNMC_N_191/ /Работа/пользователь/1007/GVFS/кого-л-доля : сервер = xeonator, доля = с/Результаты/нормалей/8_mo/204-196/

у меня есть программа (назовем его 'прога'), который принимает 3 параметра, 2 входные имена файлов и 1 выходного файла. Нормальное исполнение:

prog ~/A.txt ~/B.txt ~/out.txt 

Я хочу, чтобы выполнить параллельно свою программу с параметрами, построенных на основе каждой строки файла, например:

prog /run/user/1007/gvfs/smb-share:server=xeonator,share=c/Results/Normals/8_mo/CNMC_N_191/A.txt /run/user/1007/gvfs/smb-share:server=xeonator,share=c/Results/Normals/8_mo/CNMC_N_191/B.txt /run/user/1007/gvfs/smb-share:server=xeonator,share=c/Results/Normals/8_mo/CNMC_N_191/out.txt 
prog /run/user/1007/gvfs/smb-share:server=xeonator,share=c/Results/Normals/8_mo/204-196/A.txt /run/user/1007/gvfs/smb-share:server=xeonator,share=c/Results/Normals/8_mo/204-196/B.txt /run/user/1007/gvfs/smb-share:server=xeonator,share=c/Results/Normals/8_mo/204-196/out.txt 

Я пытался использовать xargs и GNU параллельно, но Я не могу создать правильную командную строку для этих инструментов. Вот моя попытка:

cat ListPaths.txt | xargs -I '{}' -n 1 -P 8 ./SkullSegmenter/SkullSegmenter '{}'A.txt '{}'B.txt '{}'out.txt 

Но это не дает правильных аргументов. Может кто-то помочь мне с этим?

Answer 1

Это следует сделать это:

cat ListPaths.txt | parallel ./SkullSegmenter/SkullSegmenter {}A.txt {}B.txt {}out.txt 

Тест с --dry-run, чтобы увидеть, если это команды, которые вы хотите запустить:

cat ListPaths.txt | parallel --dry-run ./SkullSegmenter/SkullSegmenter {}A.txt {}B.txt {}out.txt