Я использую https://github.com/AtomLinter/linter-jscs. Документы говорят:Как управлять АОС только при сохранении (не на клавиатуре) в Atom?
Это Линта редактировать и/или сохранить
кажется, что при редактировании Линц и сохранить все время. Я не вижу способа настроить его, чтобы набрать только сохранить.
Прежде всего, вы действительно должны смотреть на переезд в ESLint (linter-eslint), как все развитие на ОНК has stopped.
Что касается вашего вопроса, вы можете настроить это поведение в пакете Linter, отключив его на лету. Этот пакет является просто поставщиком услуг, позволяющим использовать код через АОС, а пакет Linter - это то, что контролирует , когда запускается и как его результаты отображаются пользователю.