Как объединить разреженные столбцы в славе данных?

Question

У меня есть сценарий R, который создает кадр данных с 61 столбцом. Файл data.frame создается путем чтения кучи csv-файлов в список data.frames, а затем слияния списка, так что обычно называемые столбцы в каждом data.frame в списке заполняют тот же столбец в результирующем файле data.frame.

Некоторые из столбцов, которые должны быть объединены, были непостоянно названы в файлах csv (например, date.received vs. received.on.date vs date.sample.received), и мне было интересно, какой лучший подход к их объединению было бы.

У меня было несколько идей:

• переименовывать столбцы перед объединением в большой lapply над списком.
• объединить столбцы, которые должны быть такими же, как только у меня data.frame, таким образом, что колонна, которая имеет значение в этой строке используется

является второй подход, возможно (и как?) или есть лучший способ?

Answer 1

Второй подход возможен, и это легко с rbind_all от dplyr. Вот как:

Прежде всего, если у вас есть информация о структуре имен столбцов, которые должны быть сложены вместе, я предлагаю вам попробовать это исправить перед укладкой, как:

colnames_synonymous <- c("date.received", "received.on.date", "date.sample.received") 

list_of_dfs <- lapply(list_of_dfs, function(df) { 
    names(df)[names(df) %in% colnames_synonymous] <- "date_received" 
    return(df) 
}) 

Теперь вы хорошо идти:

dplyr::rbind_all(list_of_dfs) 

Может быть, вам придется сделать некоторые корректировки перед тем, как все столбцы сложены правильно, но теперь, все, что вам нужно сделать, это изменение lapply функцию, чтобы сделать это. Я нахожу этот путь проще, чем преобразовывать некоторые столбцы после перезаписи.