4
Я разрабатываю пакет и рассматриваю возможность включения в него виньетки. Я использую RStudio для разработки моего пакета и следую инструкциям от Hadley Wickam для использования Rmarkdown и knitr или записи виньетки.devtools :: check не удалось из-за здания виньетки
Я могу скомпилировать виньетка при нажатии knit из Rstudio но команда devtools::check() возвращает ошибку:
==> devtools::check(cleanup = FALSE)
Updating mypackage documentation
Loading mypackage
Setting env vars ---------------------------------------------------------------
CFLAGS : -Wall -pedantic
CXXFLAGS :-Wall -pedantic
Building mypackage ---------------------------------------------------------------
'/Library/Frameworks/R.framework/Resources/bin/R' --no-site-file
--no-environ \ --no-save --no-restore --quiet CMD build \ '/Volumes/Stockage/Dropbox/R/Packages/mypackage' --no-resave-data \
--no-manual
* checking for file ‘/Volumes/Stockage/Dropbox/R/Packages/mypackage/DESCRIPTION’ ... OK
* preparing ‘mypackage’:
* checking DESCRIPTION meta-information ... OK
* cleaning src
* installing the package to build vignettes
* creating vignettes ...
ERROR Error: processing vignette 'mypackage-vignette.Rmd' failed with diagnostics: It seems you should call rmarkdown::render() instead of knitr::knit2html() because mistral-vignette.Rmd appears to be an R Markdown v2 document.
Execution halted
Error: Command failed (1)
In addition: Warning message:
`cleanup` is deprecated
Execution halted
Exited with status 1.
Что я должен сделать или изменить? Я знаю, что это всего лишь чек.
Информация Сессия:
> sessionInfo()
R version 3.3.1 (2016-06-21)
Platform: x86_64-apple-darwin13.4.0 (64-bit)
Running under: OS X 10.11.6 (El Capitan)
locale:
[1] en_US.UTF-8/en_US.UTF-8/en_US.UTF-8/C/en_US.UTF-8/en_US.UTF-8
attached base packages:
[1] stats graphics grDevices utils datasets methods base
other attached packages:
[1] ggplot2_2.1.0 foreach_1.4.3 knitr_1.14 rmarkdown_1.2
[5] mistral_2.2.1