Я пытаюсь установить архивированный пакет R bi0ps. Я загрузил файл tar.gz с https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/biOps/. Я пытаюсь установить biOps_0.2.2.tar.gz.R help Установить архивный пакет 'bi0ps' не удалось найти libtiff
Когда я пытаюсь сделать так, я получаю следующее сообщение об ошибке:
install.packages('/Users/eholdridge/Downloads/biOps_0.2.2.tar.gz',type="source")
inferring 'repos = NULL' from 'pkgs'
* installing *source* package ‘biOps’ ...
** package ‘biOps’ successfully unpacked and MD5 sums checked
checking for gcc... clang
checking whether the C compiler works... yes
checking for C compiler default output file name... a.out
checking for suffix of executables...
checking whether we are cross compiling... no
checking for suffix of object files... o
checking whether we are using the GNU C compiler... yes
checking whether clang accepts -g... yes
checking for clang option to accept ISO C89... none needed
checking how to run the C preprocessor... clang -E
checking for grep that handles long lines and -e... /usr/bin/grep
checking for egrep... /usr/bin/grep -E
checking for ANSI C header files... yes
checking for sys/types.h... yes
checking for sys/stat.h... yes
checking for stdlib.h... yes
checking for string.h... yes
checking for memory.h... yes
checking for strings.h... yes
checking for inttypes.h... yes
checking for stdint.h... yes
checking for unistd.h... yes
checking fftw3.h usability... no
checking fftw3.h presence... no
checking for fftw3.h... no
configure: WARNING: Can't find fftw3 header
checking jpeglib.h usability... no
checking jpeglib.h presence... no
checking for jpeglib.h... no
configure: WARNING: Can't find libjpeg header
checking tiff.h usability... no
checking tiff.h presence... no
checking for tiff.h... no
configure: WARNING: Can't find libtiff header
checking for jpeg_destroy_compress in -ljpeg... no
checking for TIFFOpen in -ltiff... no
Try static libs needed on OS X
checking for TIFFOpen in -ltiff... no
Error: Could not find libtiff.
ERROR: configuration failed for package ‘biOps’
* removing ‘/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.2/Resources/library/biOps’
Warning in install.packages :
installation of package ‘/Users/eholdridge/Downloads/biOps_0.2.2.tar.gz’ had non-zero exit status
Я попытался исправить эту ошибку, установив libtiff с Homebrew:
brew install libtiff
==> Downloading https://homebrew.bintray.com/bottles/libtiff-4.0.6.el_capitan.bo
Already downloaded: /Library/Caches/Homebrew/libtiff-4.0.6.el_capitan.bottle.tar.gz
==> Pouring libtiff-4.0.6.el_capitan.bottle.tar.gz
/usr/local/Cellar/libtiff/4.0.6: 259 files, 3.4M
Но я все еще получаю ту же ошибку как сообщалось выше, когда я пытаюсь установить bi0ps. Я работаю в R Studio с использованием версии:
version
_
platform x86_64-apple-darwin13.4.0
arch x86_64
os darwin13.4.0
system x86_64, darwin13.4.0
status
major 3
minor 2.2
year 2015
month 08
day 14
svn rev 69053
language R
version.string R version 3.2.2 (2015-08-14)
nickname Fire Safety
Mac OS X El Capitan. Мое лучшее предположение заключается в том, что оно либо имеет какое-то отношение к заголовкам (на основе предупреждений), либо что R ищет libtiff в неправильном каталоге. Любая помощь с этой ошибкой будет принята с благодарностью.