2013-09-17 1 views
0

Мы используем блоки MAF блока Галактики на https://main.g2.bx.psu.edu/.MAF Тип пуст при использовании стежков блоков MAF (https://main.g2.bx.psu.edu/)

1) Создайте файл BED моего романа, собранный транскрипт (координаты на основе человеческого справочного генома). Файл под названием «human_refseq_nooverlap_bed» ниже);

2) Войдите на сайт Галактики. Получить данные -> Загрузить файл -> Формат файла: «кровать», Файл: нажмите и выберите «human_refseq_nooverlap_bed», Геном: «Человек февраль 2009 г. (GRCh37/hg19) (hg19)»

3) Fetch Alignments -> Stitch MAF blocks -> Выберите интервалы: «human_refseq_nooverlap_bed», MAF Источник: «Локально кэшированные выравнивания»; enter image description here

4) MAF Тип пуст. Не могли бы вы мне помочь, спасибо.

ответ

0

В вашем файле BED проверьте наличие автоматического обнаружения в поле редактирования атрибутов. Затем снова запустите MAF, и он должен работать!