вычисления ошибки означают на кадр данных в R

Question

У меня DF создается следующим образом:

Sample Concentration 
1 Dp10 WT  121.36 
2 Dp10 WT  129.11 
3 Dp10 WT  149.46 
4  Dp10   141.3 
5  Dp10  129.11 
6  Dp10  131.02 
7 Dp16 WT    0 
8 Dp16 WT   134.8 
9 Dp16 WT   144.5 
10 Dp16  134.33 
11 Dp16  129.11 
12 Dp16  160.02 

A = matrix(
c("Dp10 WT", "Dp10 WT", "Dp10 WT", 
    "Dp10", "Dp10", "Dp10", 
    "Dp16 WT", "Dp16 WT", "Dp16 WT", 
    "Dp16", "Dp16", "Dp16", 
    121.36, 129.11, 149.46, 141.3, 129.11, 131.02, 
    0, 134.8, 144.5, 134.33, 129.11, 160.02), 
nrow=12, 
ncol=2, 
byrow = FALSE) 

dimnames(A) = list(seq(1,12) 
,c('Sample', 'Concentration')) # column names 
DF=data.frame(A) 

Но вычисления среднего значения, как показано ниже, дает мне следующее сообщение об ошибке.

mm <- ddply(DF, "Sample", summarise, conc = mean(Concentration, na.rm=TRUE)) 

Error in attributes(out) <- attributes(col) : 
'names' attribute [12] must be the same length as the vector [3] 

Я знаю, что есть некоторые различия при среднем вычислений на dataframes от R 3.0, но я не уверен, что я делаю неправильно здесь.

Answer 1

Ваши столбцы хранятся в качестве факторов. Следующие изменения для вашего кода должны работать

DF=data.frame(A,stringsAsFactors = FALSE) 
DF$Concentration = as.numeric(DF$Concentration) 
mm <- ddply(DF, "Sample", summarise, conc = mean(Concentration, na.rm=TRUE))