Не удается установить пакет rgdal в R на RHEL6, не удалось загрузить общий объект rgdal.so

Question

У меня есть сервер AWS RHEL6, где я установил (скомпилировал) пакеты rgdal 1.9.2 и proj. Теперь в R Я хочу установить rgdal пакет, но он дает эту ошибку:

** testing if installed package can be loaded
Error in dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...) :
unable to load shared object '/home/Roel/R/x86_64-redhat-linux-gnu-library/3.3/rgdal/libs/rgdal.so':
libgdal.so.1: cannot open shared object file: No such file or directory Error: loading failed
Execution halted
ERROR: loading failed
* removing ‘/home/Roel/R/x86_64-redhat-linux-gnu-library/3.3/rgdal’ Warning in install.packages :
installation of package ‘rgdal’ had non-zero exit status

Полная установка журнала можно найти here.

Когда я нахожу rgdal.so в Linux, он ничего не находит. Я также не могу найти, как получить rgdal.so того, из чего он является.

Есть ли у кого-нибудь идеи, как это исправить?

Answer 1

Я установил его:

Там ошибка далее в журнале, так что я пропустил из-за ошибки в конце:

./proj_conf_test: error while loading shared libraries: libgdal.so.1: cannot open shared object file: No such file or directory 

libgdal.so.1 был на система в/usr/local/lib.

Я тогда сделал:

echo "/usr/local/lib" >> /etc/ld.so.conf.d/R-dependencies-x86_64.conf 
ldconfig 

Это фиксированное последующее сообщение об ошибке, что я упоминал в ОП.

Answer 2

Если вы видите Отказано при запуске Рул, попробуйте:

sudo ldconfig -c "echo '/usr/local/lib' >> /etc/ld.so.conf.d/R-dependencies-x86_64.conf"