Определение высоты кластеризации дендрограммы - R

Question

В R у меня есть кластерная дендрограмма, построенная с использованием значений оси y - 0 -4.

• Как определить точные высоты разных кластеров? Некоторые из них находятся между двумя числами.

• Кроме того, я хочу автоматически отделить группы данных, сгруппированные на графике. Я столкнулся с функцией cutree, но я должен явно передать значение k, h. Возможно ли выполнить разделение без передачи значений вручную?

Answer 1

Чтобы получить высоты для различных сокращений вы можете использовать dendextend пакет с функцией heights_per_k.dendrogram. Например:

hc <- hclust(dist(USArrests[1:4,]), "ave") 
dend <- as.dendrogram(hc) 
heights_per_k.dendrogram(dend) 
##  1  2  3  4 
##86.47086 68.84745 45.98871 28.36531 

Что касается вашего второго вопроса: если вы не говорите cutree, сколько кластеров вы хотите, это не будет знать, сколько дать.