Как можно визуализировать Allen Brain Atlas (API documentation) в XTK? Какой формат следует использовать?Атлас Allen Brain в XTK?
0
A
ответ
0
Формат MHD еще не поддерживается, но вы можете преобразовать MHD в NRRD или NII с помощью таких инструментов, как Slicer4.
0
Мне нравится использовать c3d для формата тома. Он поддерживает файлы NRRD, которые, я считаю, XTK может читать.
Помимо этого: объём данных для подключения к головному мозгу Allen Mouse Точки данных Atlas используются как файлы NRRD напрямую. Тем не менее, взрослые мышиные данные о генах атласных генов являются МГД.
Спасибо за указатель на Slicer4. Однако мне не удалось экспортировать в формат, который может обрабатывать XTK. https://gist.github.com/renaud/5967402 Используя демонстрационную загрузку из Slicer4 (Загрузить MRHead), а затем сохраните ее как VTK, NII, ... – Renaud
Да, странно, что в них что-то смешное. Возвращает ли она какую-либо ошибку или показывает что-то неправильно? – Nicolas
Нет, дисплей просто пуст. Я думаю, что экспорт, который я сделал, не имеет правильного формата (ints, а не float или наоборот). – Renaud