Фингерпринт с использованием модуля python под названием pybel

Question

Я хочу получить отпечатки пальцев, используя смайлики соединений. Я сделал, но проблема в том, что я хочу получить более высокий бит и формат списка, чтобы я мог рассчитать длину списков. В этом случае я просто получаю классы. Любое решение в python с использованием pybel? Я сделал это, но когда я пишу len(fps[0]) я получаю сообщение об ошибке

import pybel 
smiles = ['CCCC', 'CCCN'] 
mols = [pybel.readstring("smi", x) for x in smiles] 
fps = [x.calcfp() for x in mols] 
print fps[0] 

Answer 1

Вы можете использовать функцию Ф.П. для объекта отпечатков пальцев. По умолчанию FP2 отпечатков пальцев рассчитывается, его длина равна 32. Существует код, длина которого выходной и бит-0

import pybel 
smiles = ['CCCC', 'CCCN'] 
mols = [pybel.readstring("smi", x) for x in smiles] 
fps = [x.calcfp() for x in mols] 
print len(fps[0].fp) 
print fps[0].fp[0] 

Результат:

32 
0