awk

3зной

3ответ

Как объединить строки в файле на основе общих полей с помощью awk?

У меня есть большая табуляция два файла столбец, который имеет координаты многих биохимических путей, как это: A B B D D F F G G I A C C P P R A M M L L X Я хочу, чтобы объединить строки,

bash unix awk merge tabs 2017-02-17

---

2зной

1ответ

Замещение определенных нуклеотидов в файлах FastaQ в Linux

У меня есть некоторые файлы fastaq, которые мне нужно проанализировать. Основная проблема заключается в том, что инструмент анализа, с которым я сейчас работаю, принимает только ACTG как нуклеотиды, а

linux string awk bioinformatics 2017-02-17

---

1зной

1ответ

ожидают, что скрипты выполнят команду awk и выдают puttng expect_out в переменной.

Кажется, что проблема, выполняющая команду awk в swn ssh в моем скрипте. Кроме того, я не могу получить вывод переменной. set file [open "hosts.test"] set hosts [split [read -nonewline $file] "\n"]

variables awk expect 2017-02-17

---

-2зной

3ответ

Возможна ли сортировка по нескольким столбцам в awk?

Сортировать по третьей колонке и четвертой колонке ввода B,c,3, G,h,2, J,k,4, M,n,,1 Выходной M,n,,1 G,h,2, B,c,3, J,k,4, Пожалуйста, помогите мне ОБНОВЛЕНО awk -F, 'a[$3]<$4{a[$3]=$4;b[$3]

awk 2017-02-18

---

-2зной

2ответ

Регулярное выражение для поиска ровно двух непоследовательных символов в строке с использованием grep/awk

Это то, что у меня есть. grep "\(r\)\1" file Как приспособить это, чтобы сделать его соответствовать двум возможно непоследовательные r сек?

regex awk grep 2017-02-18

---