pheatmap

0зной

1ответ

Какую цветовую клавишу использовать в тепловой карте с небольшим диапазоном значений?

Мои данные покрывают небольшой диапазон, но мне все же нравится делать небольшие различия между точками данных, видимыми в тепловой карте. Какую цветовую клавишу лучше всего использовать для повышения

2зной

1ответ

Цвет Pheatmap для определенного значения

Я очень новичок в R, и недавно я играл с библиотекой fheatmap, чтобы генерировать, ну, карты тепла. Моя проблема заключается в том, что я хочу покрасить свою тепловую карту определенным образом. Я опи

1зной

2ответ

Определить конкретное значение окраски с pheatmap в R

Скажем: m1<-matrix(rnorm(1000),ncol=100) и определение цветов: cols = colorRampPalette(c("white", "red"))(30) Я производящий Heatmap без кластеризация с функцией pheatmap: pheatmap(dist(t(m1)), cl

0зной

1ответ

Можете ли вы извлечь матрицу данных из pheatmap в R?

Я создал карту тепла, основанную на данных микроматрицы гена, а затем использовал pheatmap для кластеризации данных и вывода тепловой карты. Есть ли способ вывода кластеризованных данных тепловой карт

0зной

1ответ

как изменить цвет легенды строк в тепловой карте?

Я хотел бы обратить аннотацию по умолчанию для строки: library(NMF) #any other packages for this task are welcome car<-cars car$p<-sample(1:600, 50)*0.0001 aheatmap(as.matrix(cars[,1:2,drop=FALSE])

2зной

1ответ

Использование pheatmap в аранжировкеGrob

Я пытаюсь сделать два графика в одной и той же .jpg с помощью organizeGrob(). Я только начал изучать гриды и грызуны, и я думаю, что знаю, в чем проблема: pheatmap - это объект сетки и содержит объект

0зной

1ответ

Plot сгруппированных значения в dataframe в R

У меня есть следующий dataframe: stat mTADs DE_genes 5267 -5.452819 chr2:167337500-167447500 chr2:167318145-167341673:+ 5268 4.114012 chr6:41532500-41642500 chr6:41555481-41570508