sungridengine

0зной

2ответ

Приоритезация заданий в очереди серверов Sun Grid

У меня есть куча заданий, выстроенных для обработки в очереди Sun Grid Engine, но я только что представил новое задание, которое я хотел бы расставить приоритеты. (Новое задание - 163981 в самом левом

queue sungridengine 2014-10-12

---

0зной

1ответ

Использовать переменные в качестве параметров аргументов внутри сценария qsub

Я хочу выбрать несколько моделей из папки и использовать их в сценарии sge для задания массива. Так что я следующий в SGE сценария: MODELS=/home/sahil/Codes/bistable/models numModels=(`ls $MODELS|wc

bash sungridengine qsub 2014-09-12

---

1зной

2ответ

Отправка задания SGE в PBS/Torque

Привет Я настраиваю программный конвейер (обширный инструмент для биоинформационных аннотаций), который был первоначально написан для отправки заданий SGE, но я нахожусь в кластере PBS/Torque. Любые и

converter sungridengine pbs qsub torque 2014-09-29

---

0зной

1ответ

TopHat не удалось найти индекс Боути файлы, даже если правильный путь

Я создал бабочку индексные файлы с помощью бабочку-индекса в Баш скрипт следующим образом: bowtie-build $FA_FILE $OUTPUT_BASE (сценарий можно найти здесь: https://github.com/kennethphough/bioinforma

bash bioinformatics sungridengine 2014-10-05

---

0зной

1ответ

Грид-движок и общие библиотеки

Мой вопрос: если у меня есть исполняемый файл, который требует некоторых библиотек, то мне нужно установить эти библиотеки на все узлы сетки или есть способ установить libs на один узел а затем подели

cluster-computing sungridengine 2014-10-13

---