Не знаю, возможен ли «автоматический» вход с IE.
Но вы можете использовать «классическую» форму входа (стиль Java EE) и позволить Tomcat выполнять вход в Active Directory с использованием JNDI Realm.
изменить область по умолчанию в вашем server.xml или установить область в context.xml вашего приложения, как это:
<Realm
className="org.apache.catalina.realm.JNDIRealm"
debug="99"
connectionURL="ldap://your-activedirectory-server:389"
connectionName="a user with read access to AD (optional if anonymous access is permitted)"
connectionPassword="password"
referrals="follow"
userBase="where to look for users, for instance: DC=mycompany,DC=com"
userSearch="(sAMAccountName={0})"
userSubtree="true"
roleBase="where to look for groups, for instance: DC=mycompany,DC=com"
roleName="cn"
roleSearch="(member={0})"
roleSubtree="true"/>
Больше информации здесь: Apache Tomcat 5.5 Realm Configuration HOW-TO
И: Active Directory Integration
Дубликат http://stackoverflow.com/questions/267869/configuring-tomcat-to-authenticate-using-windows-active-directory – Raedwald 2012-10-08 15:19:52