Часто упоминается, в том числе в комментарии здесь, что «вам нужно перекомпилировать R», чтобы использовать другую библиотеку BLAS или LAPACK. Это не правильно.
не нужно перекомпилировать R при условии, что он построен против версий библиотеки BLAS и LAPACK.
У меня есть package and vignette on CRAN, который использует этот факт, чтобы обеспечить базовую платформу, в которой разные версии BLAS и LAPACK приурочены к каждому, просто устанавливая разные (один комманд в Debian/Ubuntu) и работая с эталонами - это так просто что он может быть автоматизирован в таком пакете.
Результаты этого пакета обеспечат представление о возможных различиях в скорости. Именно то, как они работают, зависит от вашего компьютера, ваших данных (размера), вашей проблемы и т. Д. Но если, скажем, ваша проблема использует функции LAPACK, которые могут использовать преимущества многопоточности, то установка OpenBLAS может помочь. Это справедливо для любого пакета R, использующего LAPACK , поскольку они будут использовать одну и ту же установку LAPACK, доступ к которой осуществляется через, и они могут быть изменены.
Вы должны скомпилировать все, что связано с BLAS/ATLAS/MKL/OPENBLAS, то есть с самим R, а также со всеми пакетами, требующими компиляции. –
Спасибо за комментарий Паскаль. Так будет ли улучшение скорости использовать существующий пакет кода C/C++ R, если я компилирую BLAS/ATLAS и т. Д.? –
@Pascal: Это неверно, и я привел немного более подробно ниже. –