Может кто-нибудь, пожалуйста, дайте мне небольшой пример того, какие данные микроматрицы, которые я импортирую в LIMMA, должны выглядеть, когда я импортирую их в R?Формат данных, используемый при работе с LIMMA в R
Я пытаюсь расшифровать дифференциально регулируемые гены из образца микрочипов. Благодарю.
Вкладка (или любой другой) разделенный файл с нормализованными уровнями экспрессии с дополнительно столбцом с идентификаторами зондов (или другими идентификаторами генов) и заголовком, который определяет выборки - вообще говоря.
Чтобы получить пример нужного кода, я предлагаю вам ознакомиться с созданным скриптом geo2r (доступным из любого набора данных GEO) и прочитать виньетку limma.