bioconductor

5зной

3ответ

путь установки не доступен для записи R, не удалось обновить пакеты

Я пытаюсь установить Bioconductor в R, используя код на своем веб-сайте. Когда я ввожу код (см. Ниже), я получаю сообщение об ошибке, в котором говорится, что некоторые пакеты не могут быть обновлены,

1зной

1ответ

Отсутствующие значения в lmFit [пакет limma R]

[Этот вопрос специфичен для биоинформатики. Есть сообщения в другом месте, но я не мог найти удовлетворительный ответ.] Если у меня есть/экспрессия белка гена данные с пропущенными значениями (NA), ка

2зной

1ответ

model.matrix и makeContrasts в R

Я хотел бы сделать некоторые контрасты с помощью линейного регрессионного моделирования в R. У меня есть следующие данные, mat1: Gene1 Gene2 Gene3 1 5.89 7.45 2.66 2 8.99 5.39 1.58 3 3.67 6.88 4

0зной

1ответ

Установка Bioconductor highthroughputassays рабочий процесс дает RGL ошибок и не загружать

При попытке установить Bioconductor рабочего процесса «highthroughputassays» следующим образом (и как described here): > source("http://bioconductor.org/workflows.R") > workflowInstall("highthroughpu

1зной

1ответ

Ошибка пакета MLSeq

Я хотел бы использовать пакет MLSeq, но я получаю эту ошибку. library(MLSeq) Error : object ‘bag.default’ is not exported by 'namespace:caret' Error: package or namespace load failed for ‘MLSeq’ Как я

3зной

1ответ

Ошибка загрузки файла с GPL getGEO

Использование OSX 10.11 и R 3.3.0 Я получаю эту ошибку, используя GEOQuery пакет: library(GEOquery) GSE56045 <- getGEO("GSE56045") Он загружает GSE файл, но не GPL: Error in download.file(myurl, de

3зной

1ответ

Ошибка при установке пакета flowCore R

Я пытаюсь установить пакет flowCore (Bioconductor 3.4) в R 3.3.2 (Ubuntu 14.04 LTS). Но я получаю следующую ошибку. Может ли кто-нибудь предложить какое-то решение. boost_regex/regex.cpp:195:64: error