Этот вопрос немного старый, так что вопрос не будет точно то же самое сейчас:
modernizer.js не требует JQuery, я думаю, что основа & приложение сделал, но zurb существенно изменил JavaScript файлы, в том числе сделаны их собственные вилки модернизатора (modernizr.foundation.js) - текущий (фундамент 2.2) «предпочтительный» порядок загрузки:
<head>
<script src="js/modernizr.foundation.js"></script>
</head>
<body>
...
...
<!-- end of container/all content -->
<script src="js/jquery-1.7.2.js"></script>
<!-- all the jQuery dependent files begin with 'jquery.' and are separated so
you can remove what you don't use -->
<script src="js/jquery.reveal.js"></script>
<script src="js/jquery.orbit-1.4.0.js"></script>
<script src="js/jquery.customforms.js"></script>
<script src="js/jquery.placeholder.min.js"></script>
<script src="js/jquery.tooltips.js"></script>
<!-- app.js is basic functions that you're supposed to edit -
it requires jQuery to start as well -->
<script src="js/app.js"></script>
</body>