Это действительно зависит от программного обеспечения, которое вы будете использовать. Если вы используете TensorFlow, существует поддержка нескольких GPUS. В этом случае я получил бы машину с 2 Nvidia GTX 1080 с SLI (я думаю, будет сложно получить коммерческую машину с более чем такой). Вы можете получить что-то вроде HP OMEN X, у которого есть 2 GPUS, но вы платите премию. Лучше всего найти местный магазин рядом с вами, который построит лучшую машину и скажет, что вам нравится 1000.
Если вы используете Theano, то, насколько мне известно, они поддерживают только 1 графический процессор, поэтому не имеет смысла получить больше, чем это.
Если вы используете sci-kit learn, то нет поддержки графического процессора, поэтому вместо этого вы захотите иметь быстрый процессор. Новые i7 поставляются с более чем 4 ядрами, поэтому я бы порекомендовал один из них, но если бюджет не ограничен, то вы можете получить процессоры Xeon с более чем 10 ядрами.
Но все это действительно сводится к бюджету. Когда дело доходит до этих вещей, вы можете потратить бесконечную сумму денег. Мы говорим о 3000? 5000? 10k? ... Для 3000 вы сможете получить 2x 1080 и довольно хороший i7. Это, вероятно, все, что вам нужно для большинства приложений.
[GPU для глубокого обучения] (http://hardwarerecs.s.stackexchange.com/q/1606/40) –