knitr: включить цифры в отчет * и * выводить цифры в отдельные файлы

Question

Не только мне понравятся мои цифры, которые появятся в моем сборнике, но я также хотел бы выводить их в отдельные файлы. Чтобы сделать это, я включил код, как следующее:

```{r} 
    #Plot figure in report 
    plot(x,y) 

    #Plot figure in file 
    pdf(file="MyFig.pdf") 
    plot(x,y) 
    dev.off() 
``` 

Это прекрасно работает, но я полагаю, что есть более элегантное решение для этого уже встроено в knitr. Есть ли опция куска или что-то подобное, которое дает те же результаты?

Answer 1

Используйте опцию self_contained: no, если вы используете html_document или keep_tex: yes если вы используйте pdf_document, чтобы rmarkdown не удалял файлы фигур после рендеринга выходного документа.

Answer 2

Ключевое слово DEV = 'PDF', это объясняется здесь http://yihui.name/knitr/options/

Вместе с другими вариантами я нашел полезным:

```{r 'setup', echo = FALSE, cache = FALSE} 
    opts_chunk$set(dev = c('pdf', 'png'), 
     fig.align = 'center', fig.height = 5, fig.width = 8.5, 
     pdf.options(encoding = "ISOLatin9.enc")) 
```