Представьте меня LSF файл как fllows:как написать файл LSF, чтобы направить вывод в другую папку, кроме PWD
#!/bin/sh
#BSUB -J X
#BSUB -o X.out
#BSUB -e X.err
...
После его запуска на выходе будет отображаться в текущей папке.
Теперь представьте себе, я нахожусь в
~/code
мне нужны файлы появляются в
../cluster/
в основном идут одну папку обратно, а оттуда перейти в папку кластера.
Как написать это в файле lsf?
Вы можете поместить любой относительный или абсолютный путь в #BSUB -[eo] <file>. например #BSUB -e ../cluster/X.err. Если используется относительный путь, это относится к заданию CWD. По умолчанию задание CWD является каталогом подчинения задания, но его можно изменить с помощью нескольких параметров. bjobs -l <jobid> показывает фактический CWD.
Случается, что при выполнении задания stdout и stderr отправляются в файл под LSF_TMPDIR (по умолчанию это $ HOME/.lsbatch). После завершения работы содержимое этих файлов копируется на пути, указанные в -[eo]. Копирование выполняется на хосте выполнения.